Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEU8

APPL2, DCC-interacting protein 13-beta, humanhuman

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APPL2Q8NEU8 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
APPL2Q8NEU8 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
APPL2Q8NEU8 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
APPL2Q8NEU8 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
APPL2Q8NEU8 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
APPL2Q8NEU8 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
APPL2Q8NEU8 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
APPL2Q8NEU8 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
APPL2Q8NEU8 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
APPL2Q8NEU8 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
APPL2Q8NEU8 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
APPL2Q8NEU8 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
APPL2Q8NEU8 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
APPL2Q8NEU8 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
APPL2Q8NEU8 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
APPL2Q8NEU8 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
APPL2Q8NEU8 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
APPL2Q8NEU8 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
APPL2Q8NEU8 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
APPL2Q8NEU8 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
APPL2Q8NEU8 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
APPL2Q8NEU8 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
APPL2Q8NEU8 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
APPL2Q8NEU8 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
APPL2Q8NEU8 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
APPL2Q8NEU8 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
APPL2Q8NEU8 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
APPL2Q8NEU8 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
APPL2Q8NEU8 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
APPL2Q8NEU8 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
APPL2Q8NEU8 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
APPL2Q8NEU8 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
APPL2Q8NEU8 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
APPL2Q8NEU8 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
APPL2Q8NEU8 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
APPL2Q8NEU8 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
APPL2Q8NEU8 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
APPL2Q8NEU8 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
APPL2Q8NEU8 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
APPL2Q8NEU8 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
APPL2Q8NEU8 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
APPL2Q8NEU8 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
APPL2Q8NEU8 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
APPL2Q8NEU8 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
APPL2Q8NEU8 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
APPL2Q8NEU8 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
APPL2Q8NEU8 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
APPL2Q8NEU8 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
APPL2Q8NEU8 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
APPL2Q8NEU8 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
APPL2Q8NEU8 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
APPL2Q8NEU8 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
APPL2Q8NEU8 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
APPL2Q8NEU8 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
APPL2Q8NEU8 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
APPL2Q8NEU8 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
APPL2Q8NEU8 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APPL2Q8NEU8 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
APPL2Q8NEU8 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
APPL2Q8NEU8 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APPL2Q8NEU8 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APPL2Q8NEU8 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APPL2Q8NEU8 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APPL2Q8NEU8 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
APPL2Q8NEU8 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
APPL2Q8NEU8 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
APPL2Q8NEU8 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APPL2Q8NEU8 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
APPL2Q8NEU8 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
APPL2Q8NEU8 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
APPL2Q8NEU8 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
APPL2Q8NEU8 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
APPL2Q8NEU8 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
APPL2Q8NEU8 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
APPL2Q8NEU8 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
APPL2Q8NEU8 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
APPL2Q8NEU8 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APPL2Q8NEU8 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APPL2Q8NEU8 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APPL2Q8NEU8 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
APPL2Q8NEU8 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APPL2Q8NEU8 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APPL2Q8NEU8 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APPL2Q8NEU8 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
APPL2Q8NEU8 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
APPL2Q8NEU8 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APPL2Q8NEU8 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
APPL2Q8NEU8 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APPL2Q8NEU8 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APPL2Q8NEU8 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APPL2Q8NEU8 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
APPL2Q8NEU8 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
APPL2Q8NEU8 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APPL2Q8NEU8 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APPL2Q8NEU8 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APPL2Q8NEU8 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
APPL2Q8NEU8 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APPL2Q8NEU8 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APPL2Q8NEU8 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
APPL2Q8NEU8 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms