Protein–RNA interactions for Protein: Q8N448

LNX2, Ligand of Numb protein X 2, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LNX2Q8N448 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
LNX2Q8N448 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
LNX2Q8N448 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LNX2Q8N448 TMEM132C-201ENST00000435159 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LNX2Q8N448 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LNX2Q8N448 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LNX2Q8N448 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LNX2Q8N448 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LNX2Q8N448 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
LNX2Q8N448 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
LNX2Q8N448 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LNX2Q8N448 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LNX2Q8N448 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
LNX2Q8N448 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LNX2Q8N448 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LNX2Q8N448 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LNX2Q8N448 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LNX2Q8N448 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LNX2Q8N448 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LNX2Q8N448 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LNX2Q8N448 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LNX2Q8N448 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
LNX2Q8N448 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LNX2Q8N448 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LNX2Q8N448 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LNX2Q8N448 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LNX2Q8N448 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LNX2Q8N448 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LNX2Q8N448 MTCL1-202ENST00000359865 6093 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LNX2Q8N448 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LNX2Q8N448 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LNX2Q8N448 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LNX2Q8N448 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LNX2Q8N448 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LNX2Q8N448 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LNX2Q8N448 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LNX2Q8N448 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
LNX2Q8N448 ZNF570-201ENST00000330173 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LNX2Q8N448 TRIM56-201ENST00000306085 10952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LNX2Q8N448 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LNX2Q8N448 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LNX2Q8N448 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LNX2Q8N448 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LNX2Q8N448 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LNX2Q8N448 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LNX2Q8N448 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LNX2Q8N448 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LNX2Q8N448 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LNX2Q8N448 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LNX2Q8N448 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
LNX2Q8N448 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
LNX2Q8N448 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LNX2Q8N448 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LNX2Q8N448 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
LNX2Q8N448 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
LNX2Q8N448 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
LNX2Q8N448 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LNX2Q8N448 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
LNX2Q8N448 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LNX2Q8N448 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LNX2Q8N448 Z99774.1-201ENST00000382641 2613 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LNX2Q8N448 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LNX2Q8N448 GLIS3-201ENST00000324333 6667 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LNX2Q8N448 DENND3-211ENST00000519811 5482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LNX2Q8N448 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LNX2Q8N448 SUCO-201ENST00000263688 5556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LNX2Q8N448 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LNX2Q8N448 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LNX2Q8N448 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LNX2Q8N448 ELF4-201ENST00000308167 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LNX2Q8N448 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LNX2Q8N448 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LNX2Q8N448 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LNX2Q8N448 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LNX2Q8N448 PHF14-201ENST00000403050 4276 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LNX2Q8N448 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LNX2Q8N448 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LNX2Q8N448 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LNX2Q8N448 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LNX2Q8N448 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LNX2Q8N448 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LNX2Q8N448 ITGB8-201ENST00000222573 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LNX2Q8N448 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LNX2Q8N448 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LNX2Q8N448 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LNX2Q8N448 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LNX2Q8N448 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LNX2Q8N448 RBFADN-204ENST00000568911 5187 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LNX2Q8N448 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LNX2Q8N448 GET4-202ENST00000407192 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LNX2Q8N448 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LNX2Q8N448 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LNX2Q8N448 DCUN1D4-201ENST00000334635 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LNX2Q8N448 TRPM2-204ENST00000397932 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LNX2Q8N448 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LNX2Q8N448 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LNX2Q8N448 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LNX2Q8N448 THBD-201ENST00000377103 4109 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LNX2Q8N448 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LNX2Q8N448 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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