Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW0

LMNTD2, Lamin tail domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNTD2Q8IXW0 ARRB1-202ENST00000420843 3336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LMNTD2Q8IXW0 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LMNTD2Q8IXW0 DNAJC3-AS1-201ENST00000499499 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LMNTD2Q8IXW0 COL4A1-201ENST00000375820 6532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LMNTD2Q8IXW0 TLE1-203ENST00000376499 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LMNTD2Q8IXW0 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LMNTD2Q8IXW0 PABPC1-201ENST00000318607 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LMNTD2Q8IXW0 SETD1B-202ENST00000542440 8185 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LMNTD2Q8IXW0 PHTF1-203ENST00000369600 3075 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LMNTD2Q8IXW0 SATB2-211ENST00000614512 4972 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LMNTD2Q8IXW0 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LMNTD2Q8IXW0 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LMNTD2Q8IXW0 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LMNTD2Q8IXW0 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LMNTD2Q8IXW0 RALGAPA1-201ENST00000307138 7911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LMNTD2Q8IXW0 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LMNTD2Q8IXW0 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LMNTD2Q8IXW0 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LMNTD2Q8IXW0 HAL-202ENST00000538703 2637 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LMNTD2Q8IXW0 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LMNTD2Q8IXW0 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LMNTD2Q8IXW0 PDXK-210ENST00000468090 7297 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LMNTD2Q8IXW0 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LMNTD2Q8IXW0 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LMNTD2Q8IXW0 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LMNTD2Q8IXW0 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LMNTD2Q8IXW0 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LMNTD2Q8IXW0 UACA-201ENST00000322954 6939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LMNTD2Q8IXW0 PCK2-216ENST00000561286 2012 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LMNTD2Q8IXW0 DCUN1D4-201ENST00000334635 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LMNTD2Q8IXW0 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
LMNTD2Q8IXW0 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LMNTD2Q8IXW0 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LMNTD2Q8IXW0 ITGB2-208ENST00000397857 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LMNTD2Q8IXW0 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LMNTD2Q8IXW0 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LMNTD2Q8IXW0 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
LMNTD2Q8IXW0 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LMNTD2Q8IXW0 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LMNTD2Q8IXW0 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LMNTD2Q8IXW0 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
LMNTD2Q8IXW0 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LMNTD2Q8IXW0 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LMNTD2Q8IXW0 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LMNTD2Q8IXW0 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LMNTD2Q8IXW0 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LMNTD2Q8IXW0 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LMNTD2Q8IXW0 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LMNTD2Q8IXW0 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LMNTD2Q8IXW0 CCDC117-202ENST00000421503 3766 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LMNTD2Q8IXW0 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LMNTD2Q8IXW0 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LMNTD2Q8IXW0 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LMNTD2Q8IXW0 PPP6R2-202ENST00000359139 4035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LMNTD2Q8IXW0 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LMNTD2Q8IXW0 PRMT3-202ENST00000331079 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LMNTD2Q8IXW0 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LMNTD2Q8IXW0 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LMNTD2Q8IXW0 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LMNTD2Q8IXW0 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LMNTD2Q8IXW0 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LMNTD2Q8IXW0 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LMNTD2Q8IXW0 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LMNTD2Q8IXW0 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LMNTD2Q8IXW0 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LMNTD2Q8IXW0 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LMNTD2Q8IXW0 MYD88-201ENST00000396334 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LMNTD2Q8IXW0 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LMNTD2Q8IXW0 SLC29A1-201ENST00000371708 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LMNTD2Q8IXW0 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LMNTD2Q8IXW0 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LMNTD2Q8IXW0 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LMNTD2Q8IXW0 ACTR10-201ENST00000254286 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LMNTD2Q8IXW0 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LMNTD2Q8IXW0 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
LMNTD2Q8IXW0 CCSER2-203ENST00000372088 7657 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LMNTD2Q8IXW0 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LMNTD2Q8IXW0 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LMNTD2Q8IXW0 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
LMNTD2Q8IXW0 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LMNTD2Q8IXW0 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LMNTD2Q8IXW0 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LMNTD2Q8IXW0 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LMNTD2Q8IXW0 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LMNTD2Q8IXW0 WASHC2C-201ENST00000336378 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LMNTD2Q8IXW0 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LMNTD2Q8IXW0 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
LMNTD2Q8IXW0 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
LMNTD2Q8IXW0 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LMNTD2Q8IXW0 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LMNTD2Q8IXW0 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LMNTD2Q8IXW0 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LMNTD2Q8IXW0 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LMNTD2Q8IXW0 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LMNTD2Q8IXW0 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LMNTD2Q8IXW0 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LMNTD2Q8IXW0 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LMNTD2Q8IXW0 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LMNTD2Q8IXW0 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LMNTD2Q8IXW0 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms