Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXQ3

C9orf40, Uncharacterized protein C9orf40, humanhuman

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Length 194 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf40Q8IXQ3 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
C9orf40Q8IXQ3 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
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C9orf40Q8IXQ3 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
C9orf40Q8IXQ3 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
C9orf40Q8IXQ3 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
C9orf40Q8IXQ3 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
C9orf40Q8IXQ3 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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C9orf40Q8IXQ3 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
C9orf40Q8IXQ3 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
C9orf40Q8IXQ3 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
C9orf40Q8IXQ3 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
C9orf40Q8IXQ3 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
C9orf40Q8IXQ3 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
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C9orf40Q8IXQ3 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
C9orf40Q8IXQ3 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
C9orf40Q8IXQ3 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
C9orf40Q8IXQ3 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
C9orf40Q8IXQ3 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
C9orf40Q8IXQ3 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
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C9orf40Q8IXQ3 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
C9orf40Q8IXQ3 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
C9orf40Q8IXQ3 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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C9orf40Q8IXQ3 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
C9orf40Q8IXQ3 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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C9orf40Q8IXQ3 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
C9orf40Q8IXQ3 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
C9orf40Q8IXQ3 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
C9orf40Q8IXQ3 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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C9orf40Q8IXQ3 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
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C9orf40Q8IXQ3 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
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C9orf40Q8IXQ3 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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C9orf40Q8IXQ3 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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C9orf40Q8IXQ3 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
C9orf40Q8IXQ3 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
C9orf40Q8IXQ3 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
C9orf40Q8IXQ3 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
C9orf40Q8IXQ3 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
C9orf40Q8IXQ3 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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C9orf40Q8IXQ3 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
C9orf40Q8IXQ3 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
C9orf40Q8IXQ3 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
C9orf40Q8IXQ3 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
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C9orf40Q8IXQ3 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
C9orf40Q8IXQ3 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
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C9orf40Q8IXQ3 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
C9orf40Q8IXQ3 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
C9orf40Q8IXQ3 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
C9orf40Q8IXQ3 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
C9orf40Q8IXQ3 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
C9orf40Q8IXQ3 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
C9orf40Q8IXQ3 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
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