Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z353

HDX, Highly divergent homeobox, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDXQ7Z353 KRT33B-201ENST00000251646 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HDXQ7Z353 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HDXQ7Z353 CARS-214ENST00000529772 2637 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HDXQ7Z353 SYK-203ENST00000375751 4936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HDXQ7Z353 LPCAT1-201ENST00000283415 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HDXQ7Z353 ERVK13-1-207ENST00000569465 3321 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HDXQ7Z353 CEP131-201ENST00000269392 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HDXQ7Z353 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HDXQ7Z353 ING4-201ENST00000341550 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HDXQ7Z353 ZNF519-206ENST00000589498 2117 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HDXQ7Z353 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HDXQ7Z353 MED15-204ENST00000406969 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HDXQ7Z353 AOC1-204ENST00000467291 2857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HDXQ7Z353 DDX43-201ENST00000370336 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HDXQ7Z353 DCAF8-201ENST00000326837 3972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HDXQ7Z353 LIMK1-208ENST00000538333 2170 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HDXQ7Z353 GSE1-203ENST00000405402 4366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HDXQ7Z353 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HDXQ7Z353 PRKAR2A-202ENST00000296446 3318 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HDXQ7Z353 CTCFL-208ENST00000432255 2955 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HDXQ7Z353 GPRC5B-209ENST00000569479 2984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
HDXQ7Z353 GOPC-202ENST00000368498 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HDXQ7Z353 GRHL1-202ENST00000405379 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HDXQ7Z353 USP40-208ENST00000450966 5616 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HDXQ7Z353 PCDHA11-202ENST00000616325 3418 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
HDXQ7Z353 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
HDXQ7Z353 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
HDXQ7Z353 Z98257.2-202ENST00000641138 1548 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
HDXQ7Z353 MYRIP-204ENST00000444716 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HDXQ7Z353 TMEM2-202ENST00000377044 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HDXQ7Z353 AC005394.2-201ENST00000592347 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HDXQ7Z353 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HDXQ7Z353 GDPGP1-202ENST00000558017 5323 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HDXQ7Z353 SPTBN2-210ENST00000611817 2890 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HDXQ7Z353 MIR193BHG-211ENST00000641433 5365 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
HDXQ7Z353 ABCC10-204ENST00000372530 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HDXQ7Z353 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HDXQ7Z353 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HDXQ7Z353 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HDXQ7Z353 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HDXQ7Z353 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HDXQ7Z353 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HDXQ7Z353 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HDXQ7Z353 FAM189A2-204ENST00000455972 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HDXQ7Z353 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HDXQ7Z353 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HDXQ7Z353 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HDXQ7Z353 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HDXQ7Z353 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HDXQ7Z353 CYP26B1-201ENST00000001146 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HDXQ7Z353 PTPRH-202ENST00000376350 3877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HDXQ7Z353 PSD-202ENST00000406432 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HDXQ7Z353 CACNA2D2-204ENST00000424201 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HDXQ7Z353 AMER2-201ENST00000357816 10055 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HDXQ7Z353 HSD17B4-201ENST00000256216 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HDXQ7Z353 TCF3-201ENST00000262965 4451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HDXQ7Z353 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HDXQ7Z353 MTSS1-201ENST00000325064 2777 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HDXQ7Z353 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HDXQ7Z353 UBFD1-207ENST00000567212 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HDXQ7Z353 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HDXQ7Z353 GATA2-201ENST00000341105 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HDXQ7Z353 DGKD-201ENST00000264057 6297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HDXQ7Z353 PDE9A-202ENST00000328862 1956 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HDXQ7Z353 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HDXQ7Z353 COL4A1-201ENST00000375820 6532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HDXQ7Z353 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HDXQ7Z353 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HDXQ7Z353 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HDXQ7Z353 ITGB8-201ENST00000222573 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HDXQ7Z353 USP22-201ENST00000261497 5220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HDXQ7Z353 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HDXQ7Z353 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HDXQ7Z353 ASAP1-201ENST00000357668 6344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HDXQ7Z353 MARK2-205ENST00000408948 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HDXQ7Z353 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HDXQ7Z353 NGEF-201ENST00000264051 3215 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HDXQ7Z353 TMEM41A-203ENST00000421852 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HDXQ7Z353 PRR26-202ENST00000441152 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HDXQ7Z353 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HDXQ7Z353 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HDXQ7Z353 AC239798.2-201ENST00000415338 3540 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HDXQ7Z353 IFT81-202ENST00000361948 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HDXQ7Z353 CYP4F11-204ENST00000591841 2531 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HDXQ7Z353 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HDXQ7Z353 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HDXQ7Z353 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HDXQ7Z353 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HDXQ7Z353 AL391647.1-201ENST00000395664 511 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
HDXQ7Z353 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HDXQ7Z353 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HDXQ7Z353 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
HDXQ7Z353 AC016730.1-201ENST00000420828 832 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HDXQ7Z353 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HDXQ7Z353 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HDXQ7Z353 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HDXQ7Z353 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HDXQ7Z353 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HDXQ7Z353 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HDXQ7Z353 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms