Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXH8

CCBE1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCBE1Q6UXH8 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 TDRD5-201ENST00000294848 3525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 NPNT-211ENST00000506666 2187 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 CYB561D1-206ENST00000496961 3424 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 EBF3-201ENST00000355311 2993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 RAB44-202ENST00000612677 4233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 TIPARP-201ENST00000295924 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 BAIAP2-202ENST00000321300 2879 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 NOTCH1-201ENST00000277541 9371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 C8B-201ENST00000371237 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 AL358933.1-201ENST00000565046 2830 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 GTF2IRD2-201ENST00000451013 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 SIRT5-203ENST00000379262 2339 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 HELLS-202ENST00000348459 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 GGT1-203ENST00000400382 2628 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 A1CF-203ENST00000373995 2211 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 SETD3-204ENST00000436070 2592 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 RTN4-202ENST00000337526 4790 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 SYNPO-205ENST00000522122 5098 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 ZBTB49-201ENST00000337872 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 TESMIN-204ENST00000443940 3495 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 ADGRG3-201ENST00000333493 2728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 HOXA7-201ENST00000242159 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 DNAJC13-201ENST00000260818 7730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 DENND1B-211ENST00000620048 8378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 PWWP2A-202ENST00000456329 3991 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 USP40-208ENST00000450966 5616 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 PIK3R3-203ENST00000420542 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 RIMS1-218ENST00000522291 3876 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 EWSAT1-201ENST00000415504 2214 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 GPA33-201ENST00000367868 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 STIM1-220ENST00000616714 4356 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 RIC1-203ENST00000414202 6774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 ACTN1-204ENST00000438964 3043 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 PCDHB10-201ENST00000239446 3290 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 POU2AF1-201ENST00000393067 3295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 TRAPPC10-201ENST00000291574 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 F2RL3-201ENST00000248076 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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