Protein–RNA interactions for Protein: Q6STE5

SMARCD3, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 3, humanhuman

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Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCD3Q6STE5 RAB6C-201ENST00000410061 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SMARCD3Q6STE5 UBA5-202ENST00000356232 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SMARCD3Q6STE5 ANGPTL2-202ENST00000373425 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SMARCD3Q6STE5 ATN1-201ENST00000356654 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SMARCD3Q6STE5 R3HDM2-204ENST00000402412 4372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SMARCD3Q6STE5 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SMARCD3Q6STE5 AC015712.6-201ENST00000431060 5068 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SMARCD3Q6STE5 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SMARCD3Q6STE5 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SMARCD3Q6STE5 TET3-201ENST00000305799 5174 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SMARCD3Q6STE5 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SMARCD3Q6STE5 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SMARCD3Q6STE5 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SMARCD3Q6STE5 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SMARCD3Q6STE5 RRAGD-201ENST00000359203 4042 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SMARCD3Q6STE5 NACC2-202ENST00000371753 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SMARCD3Q6STE5 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
SMARCD3Q6STE5 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SMARCD3Q6STE5 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SMARCD3Q6STE5 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SMARCD3Q6STE5 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SMARCD3Q6STE5 COBL-205ENST00000441453 3785 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SMARCD3Q6STE5 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SMARCD3Q6STE5 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SMARCD3Q6STE5 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SMARCD3Q6STE5 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SMARCD3Q6STE5 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SMARCD3Q6STE5 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SMARCD3Q6STE5 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SMARCD3Q6STE5 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SMARCD3Q6STE5 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SMARCD3Q6STE5 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SMARCD3Q6STE5 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SMARCD3Q6STE5 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SMARCD3Q6STE5 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SMARCD3Q6STE5 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SMARCD3Q6STE5 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SMARCD3Q6STE5 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SMARCD3Q6STE5 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SMARCD3Q6STE5 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SMARCD3Q6STE5 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SMARCD3Q6STE5 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SMARCD3Q6STE5 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SMARCD3Q6STE5 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SMARCD3Q6STE5 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SMARCD3Q6STE5 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SMARCD3Q6STE5 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SMARCD3Q6STE5 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SMARCD3Q6STE5 MAGI3-202ENST00000369611 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SMARCD3Q6STE5 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SMARCD3Q6STE5 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SMARCD3Q6STE5 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SMARCD3Q6STE5 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SMARCD3Q6STE5 CCDC180-210ENST00000529487 5242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SMARCD3Q6STE5 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SMARCD3Q6STE5 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SMARCD3Q6STE5 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SMARCD3Q6STE5 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SMARCD3Q6STE5 MYLK-201ENST00000346322 5892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SMARCD3Q6STE5 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SMARCD3Q6STE5 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SMARCD3Q6STE5 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SMARCD3Q6STE5 RPS6KC1-206ENST00000543354 4082 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SMARCD3Q6STE5 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SMARCD3Q6STE5 SSTR3-201ENST00000610913 4100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SMARCD3Q6STE5 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SMARCD3Q6STE5 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SMARCD3Q6STE5 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SMARCD3Q6STE5 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SMARCD3Q6STE5 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SMARCD3Q6STE5 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SMARCD3Q6STE5 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SMARCD3Q6STE5 AC005324.3-201ENST00000455584 5514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SMARCD3Q6STE5 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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SMARCD3Q6STE5 IFITM10-201ENST00000340134 3706 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SMARCD3Q6STE5 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SMARCD3Q6STE5 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SMARCD3Q6STE5 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SMARCD3Q6STE5 RIMBP2-201ENST00000261655 6321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SMARCD3Q6STE5 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
SMARCD3Q6STE5 TP73-211ENST00000604074 4806 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SMARCD3Q6STE5 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SMARCD3Q6STE5 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SMARCD3Q6STE5 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
SMARCD3Q6STE5 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SMARCD3Q6STE5 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SMARCD3Q6STE5 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
SMARCD3Q6STE5 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
SMARCD3Q6STE5 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SMARCD3Q6STE5 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
SMARCD3Q6STE5 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SMARCD3Q6STE5 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
SMARCD3Q6STE5 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SMARCD3Q6STE5 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SMARCD3Q6STE5 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SMARCD3Q6STE5 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
SMARCD3Q6STE5 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SMARCD3Q6STE5 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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