Protein–RNA interactions for Protein: Q658N2

WSCD1, WSC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 575 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WSCD1Q658N2 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
WSCD1Q658N2 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
WSCD1Q658N2 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
WSCD1Q658N2 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
WSCD1Q658N2 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
WSCD1Q658N2 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
WSCD1Q658N2 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
WSCD1Q658N2 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
WSCD1Q658N2 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
WSCD1Q658N2 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
WSCD1Q658N2 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
WSCD1Q658N2 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
WSCD1Q658N2 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
WSCD1Q658N2 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
WSCD1Q658N2 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
WSCD1Q658N2 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
WSCD1Q658N2 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
WSCD1Q658N2 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
WSCD1Q658N2 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
WSCD1Q658N2 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
WSCD1Q658N2 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
WSCD1Q658N2 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
WSCD1Q658N2 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
WSCD1Q658N2 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
WSCD1Q658N2 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
WSCD1Q658N2 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
WSCD1Q658N2 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
WSCD1Q658N2 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
WSCD1Q658N2 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
WSCD1Q658N2 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
WSCD1Q658N2 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
WSCD1Q658N2 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
WSCD1Q658N2 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
WSCD1Q658N2 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
WSCD1Q658N2 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
WSCD1Q658N2 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
WSCD1Q658N2 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
WSCD1Q658N2 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
WSCD1Q658N2 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
WSCD1Q658N2 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
WSCD1Q658N2 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
WSCD1Q658N2 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
WSCD1Q658N2 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
WSCD1Q658N2 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
WSCD1Q658N2 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
WSCD1Q658N2 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
WSCD1Q658N2 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
WSCD1Q658N2 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
WSCD1Q658N2 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
WSCD1Q658N2 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
WSCD1Q658N2 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
WSCD1Q658N2 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
WSCD1Q658N2 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
WSCD1Q658N2 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
WSCD1Q658N2 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
WSCD1Q658N2 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
WSCD1Q658N2 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
WSCD1Q658N2 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
WSCD1Q658N2 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
WSCD1Q658N2 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
WSCD1Q658N2 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
WSCD1Q658N2 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
WSCD1Q658N2 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
WSCD1Q658N2 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
WSCD1Q658N2 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
WSCD1Q658N2 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
WSCD1Q658N2 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
WSCD1Q658N2 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
WSCD1Q658N2 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
WSCD1Q658N2 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
WSCD1Q658N2 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
WSCD1Q658N2 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
WSCD1Q658N2 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
WSCD1Q658N2 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
WSCD1Q658N2 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
WSCD1Q658N2 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
WSCD1Q658N2 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
WSCD1Q658N2 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
WSCD1Q658N2 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
WSCD1Q658N2 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
WSCD1Q658N2 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
WSCD1Q658N2 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
WSCD1Q658N2 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
WSCD1Q658N2 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
WSCD1Q658N2 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
WSCD1Q658N2 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
WSCD1Q658N2 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
WSCD1Q658N2 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
WSCD1Q658N2 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
WSCD1Q658N2 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
WSCD1Q658N2 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
WSCD1Q658N2 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
WSCD1Q658N2 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
WSCD1Q658N2 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
WSCD1Q658N2 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
WSCD1Q658N2 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
WSCD1Q658N2 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
WSCD1Q658N2 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
WSCD1Q658N2 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
WSCD1Q658N2 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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