Protein–RNA interactions for Protein: Q53G59

KLHL12, Kelch-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL12Q53G59 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 ABI2-201ENST00000261016 6634 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 ABI2-203ENST00000261018 6638 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 ZNF536-201ENST00000355537 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 CCSER2-203ENST00000372088 7657 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 IKZF1-204ENST00000349824 5757 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 AL139385.1-201ENST00000611744 3272 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 RRAGD-201ENST00000359203 4042 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 SLC6A6P1-201ENST00000413933 1850 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 SLFNL1-204ENST00000372613 2654 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 EP400NL-206ENST00000446190 3697 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 EIF4G1-219ENST00000435046 4668 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC13.53□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 FP325330.2-201ENST00000624219 5630 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 COL6A3-203ENST00000353578 9963 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 HBP1-212ENST00000485846 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 RER1-207ENST00000488353 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 ADAM33-201ENST00000350009 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 HNRNPUL1-204ENST00000392006 3555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 LAMB2-201ENST00000305544 5643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 LRRC8C-201ENST00000370454 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 FFAR4-201ENST00000371481 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 FRMD4B-201ENST00000398540 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 APLP2-203ENST00000338167 3270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 TAS1R3-201ENST00000339381 3433 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 PLD2-201ENST00000263088 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 AC092634.8-201ENST00000639687 773 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms