Protein–RNA interactions for Protein: Q16384

SSX1, Protein SSX1, humanhuman

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Length 188 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX1Q16384 RNF43-205ENST00000581868 2610 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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SSX1Q16384 MMP14-201ENST00000311852 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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SSX1Q16384 HSPA1L-201ENST00000375654 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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SSX1Q16384 ATP6V0A4-202ENST00000353492 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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SSX1Q16384 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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SSX1Q16384 STIM1-201ENST00000300737 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SSX1Q16384 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SSX1Q16384 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SSX1Q16384 AC068075.1-201ENST00000519714 1832 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SSX1Q16384 DLX1-203ENST00000361725 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SSX1Q16384 TFR2-205ENST00000462107 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
SSX1Q16384 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
SSX1Q16384 PLA2G4B-201ENST00000452633 2985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
SSX1Q16384 PLIN3-207ENST00000592528 2154 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
SSX1Q16384 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
SSX1Q16384 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
SSX1Q16384 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
SSX1Q16384 RPUSD4-201ENST00000298317 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SSX1Q16384 CILP2-201ENST00000291495 4199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SSX1Q16384 ACIN1-204ENST00000397341 2738 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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