Protein–RNA interactions for Protein: Q16342

PDCD2, Programmed cell death protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD2Q16342 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PDCD2Q16342 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PDCD2Q16342 PPP1R3D-201ENST00000370996 3630 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PDCD2Q16342 LRP8-203ENST00000354412 2553 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PDCD2Q16342 AC040174.1-201ENST00000563003 2571 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PDCD2Q16342 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PDCD2Q16342 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PDCD2Q16342 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PDCD2Q16342 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PDCD2Q16342 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PDCD2Q16342 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PDCD2Q16342 YTHDF3-201ENST00000517371 3122 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PDCD2Q16342 ISY1-RAB43-201ENST00000418265 4868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PDCD2Q16342 LPO-203ENST00000421678 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PDCD2Q16342 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PDCD2Q16342 WIZ-202ENST00000389282 4067 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PDCD2Q16342 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PDCD2Q16342 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PDCD2Q16342 MYO16-202ENST00000356711 6874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PDCD2Q16342 RIC1-204ENST00000418622 6658 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PDCD2Q16342 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PDCD2Q16342 FIG4-201ENST00000230124 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PDCD2Q16342 IGF2-203ENST00000381395 4527 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PDCD2Q16342 NOX5-202ENST00000388866 2804 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PDCD2Q16342 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PDCD2Q16342 GRIN1-206ENST00000371559 3577 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PDCD2Q16342 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PDCD2Q16342 POU2F2-202ENST00000389341 6901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PDCD2Q16342 BRSK2-207ENST00000528710 3528 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PDCD2Q16342 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PDCD2Q16342 SCNN1A-201ENST00000228916 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PDCD2Q16342 PLD1-201ENST00000331659 2906 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PDCD2Q16342 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PDCD2Q16342 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PDCD2Q16342 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PDCD2Q16342 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PDCD2Q16342 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PDCD2Q16342 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PDCD2Q16342 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PDCD2Q16342 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PDCD2Q16342 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
PDCD2Q16342 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PDCD2Q16342 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
PDCD2Q16342 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PDCD2Q16342 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PDCD2Q16342 SLC6A5-202ENST00000525748 7084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PDCD2Q16342 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PDCD2Q16342 TMEM245-201ENST00000374586 7980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PDCD2Q16342 CPSF1-212ENST00000616140 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PDCD2Q16342 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PDCD2Q16342 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PDCD2Q16342 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PDCD2Q16342 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PDCD2Q16342 PATL2-207ENST00000560775 1913 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PDCD2Q16342 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PDCD2Q16342 ACIN1-202ENST00000338631 2445 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PDCD2Q16342 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PDCD2Q16342 ZBTB1-201ENST00000358738 4119 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PDCD2Q16342 SETD3-204ENST00000436070 2592 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PDCD2Q16342 C1QTNF1-203ENST00000354124 2714 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PDCD2Q16342 MAP7-205ENST00000544465 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PDCD2Q16342 AC105206.1-202ENST00000314927 2368 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
PDCD2Q16342 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PDCD2Q16342 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PDCD2Q16342 GPR132-202ENST00000392585 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PDCD2Q16342 AC131212.3-201ENST00000624087 4219 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
PDCD2Q16342 MAP2K7-203ENST00000397983 3396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PDCD2Q16342 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PDCD2Q16342 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PDCD2Q16342 RNF43-202ENST00000577625 2198 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PDCD2Q16342 BRPF3-201ENST00000339717 4820 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PDCD2Q16342 TOMM40L-209ENST00000545897 2807 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PDCD2Q16342 BRSK1-206ENST00000590333 2977 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PDCD2Q16342 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PDCD2Q16342 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PDCD2Q16342 HECTD1-203ENST00000553700 9080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PDCD2Q16342 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PDCD2Q16342 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PDCD2Q16342 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PDCD2Q16342 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PDCD2Q16342 RAB37-202ENST00000392610 2858 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PDCD2Q16342 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PDCD2Q16342 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PDCD2Q16342 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
PDCD2Q16342 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
PDCD2Q16342 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PDCD2Q16342 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PDCD2Q16342 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PDCD2Q16342 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PDCD2Q16342 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PDCD2Q16342 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PDCD2Q16342 ATG3-202ENST00000402314 3010 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PDCD2Q16342 CNTN1-203ENST00000547702 3033 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PDCD2Q16342 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PDCD2Q16342 VAPA-202ENST00000400000 6815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PDCD2Q16342 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PDCD2Q16342 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PDCD2Q16342 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PDCD2Q16342 ATP5J2-PTCD1-201ENST00000413834 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PDCD2Q16342 ANKRD20A19P-202ENST00000442969 2796 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
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