Protein–RNA interactions for Protein: Q15517

CDSN, Corneodesmosin, humanhuman

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Length 529 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDSNQ15517 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
CDSNQ15517 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
CDSNQ15517 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
CDSNQ15517 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
CDSNQ15517 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
CDSNQ15517 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC12.58□□□□□ -0.4
CDSNQ15517 SCAF11-203ENST00000395453 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
CDSNQ15517 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
CDSNQ15517 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
CDSNQ15517 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
CDSNQ15517 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
CDSNQ15517 RARS2-201ENST00000369536 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
CDSNQ15517 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
CDSNQ15517 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
CDSNQ15517 KCTD6-202ENST00000404589 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
CDSNQ15517 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
CDSNQ15517 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
CDSNQ15517 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
CDSNQ15517 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
CDSNQ15517 MINDY4B-201ENST00000465419 1383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
CDSNQ15517 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
CDSNQ15517 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
CDSNQ15517 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
CDSNQ15517 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
CDSNQ15517 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
CDSNQ15517 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
CDSNQ15517 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
CDSNQ15517 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
CDSNQ15517 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
CDSNQ15517 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
CDSNQ15517 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
CDSNQ15517 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
CDSNQ15517 MDS2-201ENST00000374555 1029 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
CDSNQ15517 FTCDNL1-203ENST00000420922 772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
CDSNQ15517 FAM92A-202ENST00000423990 914 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
CDSNQ15517 C17orf58-202ENST00000449250 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
CDSNQ15517 RN7SL494P-201ENST00000461517 304 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
CDSNQ15517 ZSCAN2-208ENST00000485222 910 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
CDSNQ15517 RN7SL564P-201ENST00000496309 250 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
CDSNQ15517 ANAPC15-204ENST00000535234 848 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
CDSNQ15517 AC012158.2-201ENST00000536546 354 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
CDSNQ15517 ZSCAN2-210ENST00000538076 1109 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
CDSNQ15517 NAA40-205ENST00000539656 577 ntTSL 4 BASIC12.57□□□□□ -0.4
CDSNQ15517 FAM60A-207ENST00000542983 738 ntTSL 4 BASIC12.57□□□□□ -0.4
CDSNQ15517 ANAPC15-217ENST00000545944 704 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
CDSNQ15517 DUXAP9-201ENST00000547220 665 ntTSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
CDSNQ15517 SNHG15-205ENST00000580458 710 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
CDSNQ15517 AP001029.1-201ENST00000589843 168 ntTSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
CDSNQ15517 AL133467.4-201ENST00000602953 725 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
CDSNQ15517 DUSP22-213ENST00000605035 1231 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
CDSNQ15517 HMGB1P24-201ENST00000611897 328 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
CDSNQ15517 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
CDSNQ15517 LINC00244-201ENST00000625073 613 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
CDSNQ15517 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
CDSNQ15517 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
CDSNQ15517 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
CDSNQ15517 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
CDSNQ15517 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
CDSNQ15517 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
CDSNQ15517 LILRA2-203ENST00000391737 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
CDSNQ15517 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
CDSNQ15517 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
CDSNQ15517 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
CDSNQ15517 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
CDSNQ15517 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
CDSNQ15517 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
CDSNQ15517 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
CDSNQ15517 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
CDSNQ15517 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
CDSNQ15517 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
CDSNQ15517 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
CDSNQ15517 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
CDSNQ15517 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
CDSNQ15517 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
CDSNQ15517 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
CDSNQ15517 FAM90A21P-201ENST00000510875 1396 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
CDSNQ15517 FAM90A15P-201ENST00000514465 1395 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
CDSNQ15517 FAM90A6P-201ENST00000515148 1394 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
CDSNQ15517 FAM90A16P-201ENST00000526662 1395 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
CDSNQ15517 FAM90A9P-201ENST00000527940 1395 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
CDSNQ15517 FAM90A5P-201ENST00000528738 1395 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
CDSNQ15517 FAM90A14P-201ENST00000530386 1395 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
CDSNQ15517 FAM90A13P-201ENST00000534703 1395 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
CDSNQ15517 SLC25A3-216ENST00000551917 1359 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
CDSNQ15517 GNAO1-205ENST00000563661 1351 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
CDSNQ15517 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
CDSNQ15517 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
CDSNQ15517 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
CDSNQ15517 AL672207.1-201ENST00000328462 1570 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
CDSNQ15517 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
CDSNQ15517 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
CDSNQ15517 GABRB2-205ENST00000517901 1779 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
CDSNQ15517 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
CDSNQ15517 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
CDSNQ15517 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
CDSNQ15517 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC12.56□□□□□ -0.4
CDSNQ15517 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
CDSNQ15517 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
CDSNQ15517 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
CDSNQ15517 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
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