Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

Predictions only

Length 768 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 PIK3R5-219ENST00000616147 4377 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CUL3Q13618 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CUL3Q13618 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CUL3Q13618 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CUL3Q13618 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CUL3Q13618 DCST2-202ENST00000368424 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CUL3Q13618 GRIN1-206ENST00000371559 3577 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CUL3Q13618 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CUL3Q13618 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CUL3Q13618 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CUL3Q13618 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CUL3Q13618 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CUL3Q13618 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CUL3Q13618 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
CUL3Q13618 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CUL3Q13618 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CUL3Q13618 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CUL3Q13618 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CUL3Q13618 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CUL3Q13618 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CUL3Q13618 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CUL3Q13618 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CUL3Q13618 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CUL3Q13618 ZFP28-204ENST00000591844 3475 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CUL3Q13618 SPPL2B-209ENST00000613503 3456 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CUL3Q13618 SETD1A-201ENST00000262519 6451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CUL3Q13618 CASKIN2-202ENST00000433559 3950 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CUL3Q13618 RAB6C-201ENST00000410061 3075 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CUL3Q13618 FAM171B-201ENST00000304698 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CUL3Q13618 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CUL3Q13618 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CUL3Q13618 CYP4F11-204ENST00000591841 2531 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CUL3Q13618 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CUL3Q13618 ANO10-205ENST00000414522 2450 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CUL3Q13618 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CUL3Q13618 RET-205ENST00000615310 4337 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CUL3Q13618 B4GALT6-201ENST00000237019 2128 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CUL3Q13618 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CUL3Q13618 SNPH-201ENST00000381867 5533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CUL3Q13618 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CUL3Q13618 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CUL3Q13618 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CUL3Q13618 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CUL3Q13618 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CUL3Q13618 AL118506.1-201ENST00000601296 3082 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
CUL3Q13618 AGRN-210ENST00000620552 7394 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CUL3Q13618 PEG13-201ENST00000631594 5667 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
CUL3Q13618 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CUL3Q13618 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CUL3Q13618 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CUL3Q13618 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CUL3Q13618 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
CUL3Q13618 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CUL3Q13618 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CUL3Q13618 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
CUL3Q13618 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CUL3Q13618 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CUL3Q13618 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CUL3Q13618 SLC4A7-214ENST00000455077 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CUL3Q13618 RERE-204ENST00000400908 5790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CUL3Q13618 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CUL3Q13618 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CUL3Q13618 ATP13A1-202ENST00000357324 3861 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CUL3Q13618 TNFAIP8L1-201ENST00000327473 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CUL3Q13618 TNFAIP8L1-202ENST00000536716 3845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CUL3Q13618 PCDH8-201ENST00000338862 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CUL3Q13618 PCDHGA11-201ENST00000398587 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CUL3Q13618 COL22A1-201ENST00000303045 6346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CUL3Q13618 CEMIP-201ENST00000220244 7226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CUL3Q13618 DDX43-201ENST00000370336 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CUL3Q13618 TMEM132C-201ENST00000435159 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CUL3Q13618 RP1L1-202ENST00000382483 7973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CUL3Q13618 MGLL-201ENST00000265052 4642 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CUL3Q13618 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CUL3Q13618 CD300LB-202ENST00000392621 2286 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CUL3Q13618 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
CUL3Q13618 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CUL3Q13618 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CUL3Q13618 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CUL3Q13618 KDM2B-202ENST00000377071 4595 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CUL3Q13618 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CUL3Q13618 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
CUL3Q13618 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CUL3Q13618 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
CUL3Q13618 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
CUL3Q13618 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CUL3Q13618 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CUL3Q13618 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CUL3Q13618 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CUL3Q13618 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
CUL3Q13618 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
CUL3Q13618 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
CUL3Q13618 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
CUL3Q13618 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CUL3Q13618 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CUL3Q13618 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CUL3Q13618 SCD5-202ENST00000319540 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CUL3Q13618 RIPOR3-202ENST00000327979 4377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CUL3Q13618 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CUL3Q13618 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms