Protein–RNA interactions for Protein: Q07954

LRP1, Prolow-density lipoprotein receptor-related protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 4,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP1Q07954 RNASEK-204ENST00000552039 591 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 BIRC5-211ENST00000592734 386 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 Metazoa_SRP.128-201ENST00000620543 314 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 PFDN5-220ENST00000628881 231 ntTSL 3 BASIC8.43□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 PDXDC2P-206ENST00000534700 1315 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.43□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 SVOPL-203ENST00000421622 1653 ntTSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 PGD-201ENST00000270776 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 GOLGA8K-202ENST00000512626 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 GOLGA8T-202ENST00000569052 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC8.43□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 KRT8P6-201ENST00000399259 1207 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 GGTLC4P-201ENST00000402176 664 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 AL591242.1-201ENST00000422284 343 ntTSL 2 BASIC8.43□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 GOLGA6L16P-201ENST00000441780 1299 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 CITED1-209ENST00000453707 998 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC8.43□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 NDUFA3-214ENST00000485876 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 AC022113.2-201ENST00000504935 704 ntTSL 3 BASIC8.43□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 MIR2278-201ENST00000516344 96 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 AP003785.1-201ENST00000544959 492 ntTSL 4 BASIC8.43□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 KRT8P34-201ENST00000577607 1044 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 MIR4265-201ENST00000582152 99 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 AC016582.2-202ENST00000587765 1094 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 AC007193.3-201ENST00000598616 188 ntTSL 3 BASIC8.43□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 AL365181.1-201ENST00000564032 1828 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC8.43□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 HTR3E-203ENST00000425359 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC8.43□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 CRYM-202ENST00000543948 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC8.43□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC8.42□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 TMEM95-201ENST00000330767 1169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 TEX36-AS1-202ENST00000446081 749 ntTSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 CSAG1-204ENST00000452779 627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 CASP3-205ENST00000517513 964 ntTSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 TROAP-213ENST00000550709 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.42□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 HAMP-203ENST00000598398 652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.42□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 HPX-213ENST00000615166 826 ntTSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 COQ4-201ENST00000300452 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC8.42□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC8.42□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.42□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC8.42□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 CMTM1-201ENST00000328020 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 CMTM1-202ENST00000332695 624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 CMTM1-205ENST00000379500 1064 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 KRTAP4-12-201ENST00000394014 1077 ntAPPRIS P1 BASIC8.42□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 CMTM1-209ENST00000528324 749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 CMTM1-217ENST00000533666 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 BLOC1S1-203ENST00000548925 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 HKR1-220ENST00000591259 734 ntTSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC8.42□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 AC093797.1-201ENST00000411847 1789 ntTSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 BIN3-202ENST00000399977 1340 ntTSL 2 BASIC8.42□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.42□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 ZDHHC8-201ENST00000320602 3072 ntTSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.42□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.42□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC8.42□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 FAU-201ENST00000279259 461 ntTSL 2 BASIC8.42□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 LEMD1-205ENST00000367154 786 ntTSL 2 BASIC8.42□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 KRTAP2-2-201ENST00000398477 733 ntAPPRIS P2 BASIC8.42□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 KCNMA1-AS1-201ENST00000426234 863 ntTSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 RHOQP2-201ENST00000449922 579 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 AC074389.3-201ENST00000450458 454 ntTSL 3 BASIC8.42□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 GSTT2-202ENST00000621118 1112 ntTSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 AC090386.2-201ENST00000623010 1039 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC8.42□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 C12orf65-204ENST00000429587 1326 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC8.42□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.42□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC8.42□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms