Protein–RNA interactions for Protein: Q01850

CDR2, Cerebellar degeneration-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDR2Q01850 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDR2Q01850 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDR2Q01850 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDR2Q01850 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDR2Q01850 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDR2Q01850 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDR2Q01850 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDR2Q01850 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDR2Q01850 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDR2Q01850 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDR2Q01850 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDR2Q01850 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDR2Q01850 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDR2Q01850 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDR2Q01850 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CDR2Q01850 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDR2Q01850 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDR2Q01850 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDR2Q01850 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDR2Q01850 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CDR2Q01850 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDR2Q01850 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDR2Q01850 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDR2Q01850 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDR2Q01850 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDR2Q01850 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDR2Q01850 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CDR2Q01850 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDR2Q01850 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDR2Q01850 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDR2Q01850 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CDR2Q01850 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CDR2Q01850 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDR2Q01850 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CDR2Q01850 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CDR2Q01850 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDR2Q01850 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDR2Q01850 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDR2Q01850 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDR2Q01850 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDR2Q01850 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDR2Q01850 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDR2Q01850 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDR2Q01850 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDR2Q01850 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDR2Q01850 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDR2Q01850 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CDR2Q01850 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDR2Q01850 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDR2Q01850 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDR2Q01850 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDR2Q01850 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDR2Q01850 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDR2Q01850 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDR2Q01850 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDR2Q01850 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDR2Q01850 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDR2Q01850 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDR2Q01850 TNIK-204ENST00000436636 6970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDR2Q01850 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDR2Q01850 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDR2Q01850 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDR2Q01850 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDR2Q01850 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDR2Q01850 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDR2Q01850 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDR2Q01850 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDR2Q01850 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDR2Q01850 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDR2Q01850 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDR2Q01850 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDR2Q01850 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDR2Q01850 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDR2Q01850 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDR2Q01850 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CDR2Q01850 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDR2Q01850 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CDR2Q01850 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDR2Q01850 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDR2Q01850 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDR2Q01850 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDR2Q01850 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDR2Q01850 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDR2Q01850 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDR2Q01850 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDR2Q01850 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CDR2Q01850 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDR2Q01850 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDR2Q01850 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDR2Q01850 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDR2Q01850 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDR2Q01850 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDR2Q01850 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDR2Q01850 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CDR2Q01850 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDR2Q01850 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDR2Q01850 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDR2Q01850 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDR2Q01850 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDR2Q01850 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms