Protein–RNA interactions for Protein: Q01628

IFITM3, Interferon-induced transmembrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM3Q01628 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 ZIK1-204ENST00000597850 4181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 SLC5A11-201ENST00000347898 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 VASH2-203ENST00000366965 3572 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 RGS16-201ENST00000367558 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 DENND1C-201ENST00000381480 2816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 SLC26A6-204ENST00000383733 2545 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 ANO6-203ENST00000425752 3558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 CDK3-201ENST00000425876 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 PSMD2-205ENST00000435761 2574 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 PRC1-204ENST00000442656 2060 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 PNPLA8-208ENST00000453144 3366 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC12.75□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 PHB-210ENST00000511832 1509 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 SYNPO-205ENST00000522122 5098 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 KRT18P8-201ENST00000581937 1246 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 POTEB3-201ENST00000611217 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 SLC6A10P-201ENST00000330048 3846 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 COX7A2L-202ENST00000378669 3056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 CYP4F11-201ENST00000248041 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 OS9-203ENST00000389142 2457 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 SRP72-205ENST00000510663 2473 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 EFHC1-221ENST00000636489 2421 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 GLO1-201ENST00000373365 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 HCFC2-201ENST00000229330 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 PCMTD1-208ENST00000544451 3697 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 ALDH7A1-234ENST00000637782 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 DLGAP1-204ENST00000400149 5203 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 NLRP7-201ENST00000328092 3299 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 AC000120.1-201ENST00000414227 1589 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 SEPT10-202ENST00000397712 3071 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 SCP2-203ENST00000371514 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 TBC1D14-208ENST00000451522 4149 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 LIX1L-201ENST00000604000 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC12.74□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC12.74□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 PLAT-202ENST00000352041 2516 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 SHC1-202ENST00000368445 3472 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 VAMP1-201ENST00000361716 3449 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 FAM198B-207ENST00000592057 3425 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 RHOH-217ENST00000610353 2268 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.74□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 UBTFL8-201ENST00000426903 2112 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 TIPARP-201ENST00000295924 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 HPCAL4-201ENST00000372844 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms