Protein–RNA interactions for Protein: Q01546

KRT76, Keratin, type II cytoskeletal 2 oral, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT76Q01546 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRT76Q01546 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRT76Q01546 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRT76Q01546 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRT76Q01546 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRT76Q01546 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KRT76Q01546 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KRT76Q01546 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KRT76Q01546 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KRT76Q01546 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KRT76Q01546 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KRT76Q01546 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KRT76Q01546 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KRT76Q01546 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KRT76Q01546 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KRT76Q01546 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KRT76Q01546 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
KRT76Q01546 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KRT76Q01546 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KRT76Q01546 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KRT76Q01546 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KRT76Q01546 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KRT76Q01546 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KRT76Q01546 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KRT76Q01546 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KRT76Q01546 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
KRT76Q01546 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KRT76Q01546 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
KRT76Q01546 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KRT76Q01546 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KRT76Q01546 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KRT76Q01546 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KRT76Q01546 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KRT76Q01546 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KRT76Q01546 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KRT76Q01546 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KRT76Q01546 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KRT76Q01546 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KRT76Q01546 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KRT76Q01546 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KRT76Q01546 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KRT76Q01546 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KRT76Q01546 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KRT76Q01546 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KRT76Q01546 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KRT76Q01546 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KRT76Q01546 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KRT76Q01546 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KRT76Q01546 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KRT76Q01546 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KRT76Q01546 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KRT76Q01546 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KRT76Q01546 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KRT76Q01546 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KRT76Q01546 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KRT76Q01546 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KRT76Q01546 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KRT76Q01546 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KRT76Q01546 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KRT76Q01546 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KRT76Q01546 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KRT76Q01546 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KRT76Q01546 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KRT76Q01546 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KRT76Q01546 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KRT76Q01546 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
KRT76Q01546 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KRT76Q01546 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KRT76Q01546 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KRT76Q01546 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KRT76Q01546 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
KRT76Q01546 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KRT76Q01546 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KRT76Q01546 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KRT76Q01546 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KRT76Q01546 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KRT76Q01546 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KRT76Q01546 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
KRT76Q01546 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KRT76Q01546 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
KRT76Q01546 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KRT76Q01546 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KRT76Q01546 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KRT76Q01546 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KRT76Q01546 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KRT76Q01546 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KRT76Q01546 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KRT76Q01546 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KRT76Q01546 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KRT76Q01546 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KRT76Q01546 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KRT76Q01546 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KRT76Q01546 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KRT76Q01546 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KRT76Q01546 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KRT76Q01546 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
KRT76Q01546 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
KRT76Q01546 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KRT76Q01546 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KRT76Q01546 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms