Protein–RNA interactions for Protein: Q01082

SPTBN1, Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTBN1Q01082 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
SPTBN1Q01082 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SPTBN1Q01082 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
SPTBN1Q01082 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
SPTBN1Q01082 CTSV-201ENST00000259470 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SPTBN1Q01082 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
SPTBN1Q01082 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
SPTBN1Q01082 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SPTBN1Q01082 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SPTBN1Q01082 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SPTBN1Q01082 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SPTBN1Q01082 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SPTBN1Q01082 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SPTBN1Q01082 COX8A-201ENST00000314133 507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SPTBN1Q01082 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SPTBN1Q01082 TRAPPC3-201ENST00000373159 590 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
SPTBN1Q01082 PDCD5-202ENST00000379316 154 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SPTBN1Q01082 PHACTR1-203ENST00000379335 943 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
SPTBN1Q01082 AC010900.1-201ENST00000449849 1296 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
SPTBN1Q01082 AC069185.1-202ENST00000533405 471 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
SPTBN1Q01082 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
SPTBN1Q01082 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
SPTBN1Q01082 PDCD5-208ENST00000592786 468 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
SPTBN1Q01082 DBP-202ENST00000593500 712 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
SPTBN1Q01082 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
SPTBN1Q01082 AC011462.4-201ENST00000616866 449 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
SPTBN1Q01082 MIR6746-201ENST00000620971 63 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
SPTBN1Q01082 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
SPTBN1Q01082 CD74-202ENST00000353334 1449 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SPTBN1Q01082 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SPTBN1Q01082 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SPTBN1Q01082 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
SPTBN1Q01082 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SPTBN1Q01082 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SPTBN1Q01082 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SPTBN1Q01082 KCTD6-202ENST00000404589 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
SPTBN1Q01082 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SPTBN1Q01082 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
SPTBN1Q01082 LINC01229-201ENST00000561510 1494 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
SPTBN1Q01082 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SPTBN1Q01082 EDC3-201ENST00000315127 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SPTBN1Q01082 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
SPTBN1Q01082 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SPTBN1Q01082 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SPTBN1Q01082 ZNF226-201ENST00000300823 817 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SPTBN1Q01082 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SPTBN1Q01082 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SPTBN1Q01082 NUPL2-202ENST00000410002 680 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
SPTBN1Q01082 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SPTBN1Q01082 SMAD9-IT1-201ENST00000437983 504 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
SPTBN1Q01082 WNT5A-205ENST00000497027 1299 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
SPTBN1Q01082 AC093909.3-201ENST00000504783 336 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
SPTBN1Q01082 AC105254.1-201ENST00000507782 621 ntTSL 4 BASIC12.96□□□□□ -0.33
SPTBN1Q01082 CD164-210ENST00000512821 964 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
SPTBN1Q01082 AC023389.1-201ENST00000577846 576 ntTSL 4 BASIC12.96□□□□□ -0.33
SPTBN1Q01082 AC010504.1-201ENST00000591311 585 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
SPTBN1Q01082 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SPTBN1Q01082 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
SPTBN1Q01082 CELSR1-201ENST00000262738 11389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SPTBN1Q01082 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
SPTBN1Q01082 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
SPTBN1Q01082 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
SPTBN1Q01082 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
SPTBN1Q01082 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
SPTBN1Q01082 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
SPTBN1Q01082 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
SPTBN1Q01082 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
SPTBN1Q01082 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
SPTBN1Q01082 STAG1-206ENST00000480733 1304 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
SPTBN1Q01082 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
SPTBN1Q01082 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
SPTBN1Q01082 ARRB2-218ENST00000575877 1579 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
SPTBN1Q01082 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
SPTBN1Q01082 OR52A1-202ENST00000380367 9783 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SPTBN1Q01082 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SPTBN1Q01082 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SPTBN1Q01082 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SPTBN1Q01082 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SPTBN1Q01082 GSTP1-201ENST00000398603 700 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SPTBN1Q01082 MIR4435-2HG-204ENST00000419736 777 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SPTBN1Q01082 AL391832.2-203ENST00000423175 554 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SPTBN1Q01082 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SPTBN1Q01082 RN7SL846P-201ENST00000467429 292 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
SPTBN1Q01082 LINC02171-201ENST00000508619 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SPTBN1Q01082 AC012073.1-201ENST00000606114 1108 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
SPTBN1Q01082 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SPTBN1Q01082 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SPTBN1Q01082 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SPTBN1Q01082 ITGB8-201ENST00000222573 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SPTBN1Q01082 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SPTBN1Q01082 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SPTBN1Q01082 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SPTBN1Q01082 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SPTBN1Q01082 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SPTBN1Q01082 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SPTBN1Q01082 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SPTBN1Q01082 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SPTBN1Q01082 ATF4-203ENST00000404241 1910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SPTBN1Q01082 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SPTBN1Q01082 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms