Protein–RNA interactions for Protein: Q00987

MDM2, E3 ubiquitin-protein ligase Mdm2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDM2Q00987 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC17■□□□□ 0.31
MDM2Q00987 TPGS2-209ENST00000589049 1102 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MDM2Q00987 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
MDM2Q00987 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
MDM2Q00987 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
MDM2Q00987 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
MDM2Q00987 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
MDM2Q00987 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
MDM2Q00987 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MDM2Q00987 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MDM2Q00987 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MDM2Q00987 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MDM2Q00987 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
MDM2Q00987 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MDM2Q00987 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
MDM2Q00987 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
MDM2Q00987 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MDM2Q00987 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
MDM2Q00987 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
MDM2Q00987 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
MDM2Q00987 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MDM2Q00987 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
MDM2Q00987 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MDM2Q00987 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MDM2Q00987 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
MDM2Q00987 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MDM2Q00987 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MDM2Q00987 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MDM2Q00987 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MDM2Q00987 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MDM2Q00987 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MDM2Q00987 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MDM2Q00987 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MDM2Q00987 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MDM2Q00987 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MDM2Q00987 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MDM2Q00987 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MDM2Q00987 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MDM2Q00987 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
MDM2Q00987 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MDM2Q00987 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MDM2Q00987 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MDM2Q00987 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MDM2Q00987 VPS29-201ENST00000360579 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MDM2Q00987 CELA2B-201ENST00000375910 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MDM2Q00987 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MDM2Q00987 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MDM2Q00987 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MDM2Q00987 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MDM2Q00987 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MDM2Q00987 RN7SL121P-201ENST00000584223 273 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
MDM2Q00987 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
MDM2Q00987 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MDM2Q00987 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MDM2Q00987 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MDM2Q00987 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MDM2Q00987 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MDM2Q00987 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MDM2Q00987 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MDM2Q00987 RASSF6-202ENST00000335049 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MDM2Q00987 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MDM2Q00987 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MDM2Q00987 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MDM2Q00987 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MDM2Q00987 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MDM2Q00987 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MDM2Q00987 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MDM2Q00987 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MDM2Q00987 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MDM2Q00987 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MDM2Q00987 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MDM2Q00987 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MDM2Q00987 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MDM2Q00987 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MDM2Q00987 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MDM2Q00987 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MDM2Q00987 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MDM2Q00987 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MDM2Q00987 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
MDM2Q00987 AC105389.3-201ENST00000508038 907 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MDM2Q00987 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
MDM2Q00987 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MDM2Q00987 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MDM2Q00987 UBXN1-214ENST00000533000 367 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MDM2Q00987 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MDM2Q00987 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
MDM2Q00987 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MDM2Q00987 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
MDM2Q00987 AC073352.2-201ENST00000609385 439 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
MDM2Q00987 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
MDM2Q00987 NR2F2-AS1-215ENST00000620029 1223 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MDM2Q00987 AC011491.1-203ENST00000637688 543 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
MDM2Q00987 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MDM2Q00987 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MDM2Q00987 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MDM2Q00987 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MDM2Q00987 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MDM2Q00987 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MDM2Q00987 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MDM2Q00987 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.4 ms