Protein–RNA interactions for Protein: P62829

RPL23, 60S ribosomal protein L23, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL23P62829 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
RPL23P62829 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RPL23P62829 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
RPL23P62829 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
RPL23P62829 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
RPL23P62829 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
RPL23P62829 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
RPL23P62829 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
RPL23P62829 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
RPL23P62829 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
RPL23P62829 APBB3-205ENST00000412920 1455 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RPL23P62829 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
RPL23P62829 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RPL23P62829 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RPL23P62829 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
RPL23P62829 SLC7A8-205ENST00000453702 1752 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RPL23P62829 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
RPL23P62829 GRHL1-202ENST00000405379 1881 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RPL23P62829 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
RPL23P62829 SIRT2-201ENST00000249396 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RPL23P62829 SIRT2-204ENST00000392081 2062 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RPL23P62829 ABI2-201ENST00000261016 6634 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
RPL23P62829 ABI2-203ENST00000261018 6638 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RPL23P62829 AMER1-202ENST00000374869 3688 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
RPL23P62829 LIX1L-201ENST00000604000 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RPL23P62829 AC108002.1-201ENST00000520572 5684 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RPL23P62829 ACTR3-201ENST00000263238 6718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RPL23P62829 POLD1-210ENST00000599857 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RPL23P62829 FAM122B-201ENST00000298090 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
RPL23P62829 MAPKAPK5-206ENST00000550735 11349 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RPL23P62829 FTO-214ENST00000636218 2227 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
RPL23P62829 LILRB1-203ENST00000396317 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RPL23P62829 LILRA1-201ENST00000251372 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RPL23P62829 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
RPL23P62829 SLC46A1-208ENST00000618626 5363 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RPL23P62829 MARK2P9-201ENST00000430958 1727 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
RPL23P62829 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
RPL23P62829 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
RPL23P62829 MAP3K4-203ENST00000366920 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
RPL23P62829 STRCP1-201ENST00000509801 5328 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
RPL23P62829 SF3A1-201ENST00000215793 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
RPL23P62829 HNF1B-204ENST00000617811 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
RPL23P62829 MYBBP1A-201ENST00000254718 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
RPL23P62829 ADCYAP1R1-201ENST00000304166 6487 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
RPL23P62829 PRAM1-201ENST00000423345 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
RPL23P62829 CACNA1G-203ENST00000358244 7030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
RPL23P62829 GIT2-201ENST00000320063 2094 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
RPL23P62829 THBS2-201ENST00000366787 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
RPL23P62829 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
RPL23P62829 MDM1-203ENST00000393543 2718 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
RPL23P62829 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
RPL23P62829 EDC3-201ENST00000315127 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
RPL23P62829 USP49-203ENST00000394253 9034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
RPL23P62829 RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 4625 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
RPL23P62829 MAP2K4P1-202ENST00000602584 2539 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
RPL23P62829 GTF2IRD1P1-202ENST00000457166 2426 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
RPL23P62829 GUCY1B3-204ENST00000505154 2316 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
RPL23P62829 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
RPL23P62829 UGGT2-201ENST00000376712 2240 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
RPL23P62829 THAP2-201ENST00000308086 5719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
RPL23P62829 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
RPL23P62829 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
RPL23P62829 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
RPL23P62829 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
RPL23P62829 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
RPL23P62829 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
RPL23P62829 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
RPL23P62829 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
RPL23P62829 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
RPL23P62829 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
RPL23P62829 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
RPL23P62829 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
RPL23P62829 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
RPL23P62829 ZMYND10-201ENST00000231749 2896 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
RPL23P62829 ZMIZ1-AS1-203ENST00000456353 2878 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
RPL23P62829 TUBGCP5-208ENST00000620435 3342 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
RPL23P62829 PGAP2-203ENST00000396986 1837 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
RPL23P62829 GALNT4-201ENST00000529983 5399 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
RPL23P62829 PITX2-211ENST00000613094 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
RPL23P62829 USF1-202ENST00000368020 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
RPL23P62829 C1orf109-201ENST00000358011 2355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
RPL23P62829 MSH2-206ENST00000543555 3024 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
RPL23P62829 FMNL3-205ENST00000550488 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
RPL23P62829 AC060814.4-201ENST00000594169 2163 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
RPL23P62829 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
RPL23P62829 PEX1-201ENST00000248633 4385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
RPL23P62829 EMP1-211ENST00000544053 1436 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
RPL23P62829 ENOX1-201ENST00000261488 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
RPL23P62829 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
RPL23P62829 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
RPL23P62829 C15orf39-202ENST00000394987 4430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
RPL23P62829 WAPL-201ENST00000263070 5987 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
RPL23P62829 BCCIP-202ENST00000299130 2337 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
RPL23P62829 BAIAP3-203ENST00000421665 3875 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
RPL23P62829 AL021395.1-201ENST00000611791 2232 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.59
RPL23P62829 INSRR-201ENST00000368195 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
RPL23P62829 SLC35A4-203ENST00000612662 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
RPL23P62829 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
RPL23P62829 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
RPL23P62829 ELOVL4-201ENST00000369816 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.4 ms