Protein–RNA interactions for Protein: P56545

CTBP2, C-terminal-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTBP2P56545 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CTBP2P56545 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CTBP2P56545 PCDHA11-201ENST00000398640 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CTBP2P56545 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CTBP2P56545 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CTBP2P56545 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CTBP2P56545 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CTBP2P56545 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CTBP2P56545 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CTBP2P56545 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CTBP2P56545 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CTBP2P56545 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
CTBP2P56545 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CTBP2P56545 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CTBP2P56545 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
CTBP2P56545 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CTBP2P56545 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CTBP2P56545 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CTBP2P56545 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
CTBP2P56545 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
CTBP2P56545 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CTBP2P56545 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
CTBP2P56545 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CTBP2P56545 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CTBP2P56545 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CTBP2P56545 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CTBP2P56545 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CTBP2P56545 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CTBP2P56545 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CTBP2P56545 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CTBP2P56545 SPIN3-204ENST00000638257 4835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CTBP2P56545 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CTBP2P56545 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CTBP2P56545 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CTBP2P56545 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CTBP2P56545 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTBP2P56545 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
CTBP2P56545 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTBP2P56545 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTBP2P56545 FHDC1-202ENST00000511601 6583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTBP2P56545 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTBP2P56545 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTBP2P56545 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTBP2P56545 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTBP2P56545 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTBP2P56545 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTBP2P56545 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTBP2P56545 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTBP2P56545 SYNGR1-203ENST00000328933 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTBP2P56545 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTBP2P56545 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTBP2P56545 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTBP2P56545 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTBP2P56545 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTBP2P56545 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTBP2P56545 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTBP2P56545 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTBP2P56545 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
CTBP2P56545 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTBP2P56545 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
CTBP2P56545 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTBP2P56545 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
CTBP2P56545 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTBP2P56545 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTBP2P56545 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTBP2P56545 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTBP2P56545 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTBP2P56545 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTBP2P56545 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTBP2P56545 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTBP2P56545 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTBP2P56545 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTBP2P56545 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTBP2P56545 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTBP2P56545 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTBP2P56545 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTBP2P56545 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
CTBP2P56545 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTBP2P56545 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTBP2P56545 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTBP2P56545 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTBP2P56545 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTBP2P56545 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTBP2P56545 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTBP2P56545 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTBP2P56545 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTBP2P56545 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTBP2P56545 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTBP2P56545 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTBP2P56545 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTBP2P56545 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTBP2P56545 CCDC88A-201ENST00000263630 9667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTBP2P56545 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTBP2P56545 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTBP2P56545 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTBP2P56545 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTBP2P56545 SMARCA2-208ENST00000382194 5679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTBP2P56545 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTBP2P56545 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTBP2P56545 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
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