Protein–RNA interactions for Protein: P38570

ITGAE, Integrin alpha-E, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAEP38570 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ITGAEP38570 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ITGAEP38570 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ITGAEP38570 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ITGAEP38570 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ITGAEP38570 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ITGAEP38570 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ITGAEP38570 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ITGAEP38570 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ITGAEP38570 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ITGAEP38570 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ITGAEP38570 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ITGAEP38570 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ITGAEP38570 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ITGAEP38570 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ITGAEP38570 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ITGAEP38570 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ITGAEP38570 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ITGAEP38570 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ITGAEP38570 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ITGAEP38570 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ITGAEP38570 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ITGAEP38570 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ITGAEP38570 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ITGAEP38570 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ITGAEP38570 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ITGAEP38570 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ITGAEP38570 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ITGAEP38570 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ITGAEP38570 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ITGAEP38570 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ITGAEP38570 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ITGAEP38570 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ITGAEP38570 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ITGAEP38570 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ITGAEP38570 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ITGAEP38570 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ITGAEP38570 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ITGAEP38570 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ITGAEP38570 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ITGAEP38570 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ITGAEP38570 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ITGAEP38570 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ITGAEP38570 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ITGAEP38570 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ITGAEP38570 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ITGAEP38570 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ITGAEP38570 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ITGAEP38570 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ITGAEP38570 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ITGAEP38570 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ITGAEP38570 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ITGAEP38570 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ITGAEP38570 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ITGAEP38570 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ITGAEP38570 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ITGAEP38570 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ITGAEP38570 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ITGAEP38570 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ITGAEP38570 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ITGAEP38570 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ITGAEP38570 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ITGAEP38570 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ITGAEP38570 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ITGAEP38570 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ITGAEP38570 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ITGAEP38570 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ITGAEP38570 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ITGAEP38570 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ITGAEP38570 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ITGAEP38570 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ITGAEP38570 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ITGAEP38570 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ITGAEP38570 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ITGAEP38570 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ITGAEP38570 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ITGAEP38570 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ITGAEP38570 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ITGAEP38570 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ITGAEP38570 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ITGAEP38570 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ITGAEP38570 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ITGAEP38570 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ITGAEP38570 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ITGAEP38570 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ITGAEP38570 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ITGAEP38570 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ITGAEP38570 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ITGAEP38570 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ITGAEP38570 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ITGAEP38570 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ITGAEP38570 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ITGAEP38570 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ITGAEP38570 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ITGAEP38570 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ITGAEP38570 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ITGAEP38570 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ITGAEP38570 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ITGAEP38570 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ITGAEP38570 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms