Protein–RNA interactions for Protein: P35609

ACTN2, Alpha-actinin-2, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN2P35609 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACTN2P35609 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACTN2P35609 PPP1R3D-201ENST00000370996 3630 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACTN2P35609 CELF1-201ENST00000310513 4583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACTN2P35609 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACTN2P35609 G3BP2-202ENST00000359707 4883 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACTN2P35609 LRP8-203ENST00000354412 2553 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACTN2P35609 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACTN2P35609 KIF3A-201ENST00000378735 3266 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACTN2P35609 MCHR1-201ENST00000249016 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACTN2P35609 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACTN2P35609 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACTN2P35609 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACTN2P35609 PNPLA6-201ENST00000221249 4617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACTN2P35609 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACTN2P35609 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACTN2P35609 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACTN2P35609 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACTN2P35609 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ACTN2P35609 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ACTN2P35609 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACTN2P35609 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACTN2P35609 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACTN2P35609 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACTN2P35609 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACTN2P35609 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACTN2P35609 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ACTN2P35609 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACTN2P35609 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACTN2P35609 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ACTN2P35609 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ACTN2P35609 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACTN2P35609 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACTN2P35609 CMTR2-201ENST00000338099 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACTN2P35609 OSBPL5-201ENST00000263650 3889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACTN2P35609 CBFA2T3-202ENST00000327483 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACTN2P35609 RUNX3-203ENST00000399916 4340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACTN2P35609 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACTN2P35609 RAPGEF3-218ENST00000548919 2776 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACTN2P35609 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACTN2P35609 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ACTN2P35609 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACTN2P35609 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACTN2P35609 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACTN2P35609 STRC-205ENST00000450892 5680 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACTN2P35609 GABRB3-219ENST00000636466 4509 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.14
ACTN2P35609 CD99L2-205ENST00000437787 3493 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACTN2P35609 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACTN2P35609 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACTN2P35609 NEDD4L-238ENST00000635997 4402 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACTN2P35609 MYOM3-202ENST00000374434 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACTN2P35609 TARDBP-201ENST00000240185 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACTN2P35609 KLHL21-201ENST00000377658 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACTN2P35609 HMGA2-204ENST00000403681 4473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACTN2P35609 FIBCD1-202ENST00000372338 3253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACTN2P35609 ARSH-201ENST00000381130 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACTN2P35609 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACTN2P35609 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACTN2P35609 SLC4A7-214ENST00000455077 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACTN2P35609 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACTN2P35609 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACTN2P35609 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACTN2P35609 TMCC3-201ENST00000261226 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACTN2P35609 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACTN2P35609 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ACTN2P35609 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACTN2P35609 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACTN2P35609 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACTN2P35609 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACTN2P35609 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACTN2P35609 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACTN2P35609 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACTN2P35609 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ACTN2P35609 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACTN2P35609 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACTN2P35609 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACTN2P35609 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ACTN2P35609 MX1-202ENST00000398598 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACTN2P35609 B3GNT5-202ENST00000460419 3368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACTN2P35609 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACTN2P35609 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACTN2P35609 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACTN2P35609 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACTN2P35609 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACTN2P35609 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ACTN2P35609 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACTN2P35609 ARAP3-201ENST00000239440 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACTN2P35609 ITGB4-203ENST00000450894 5645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACTN2P35609 LANCL3-202ENST00000378621 10298 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACTN2P35609 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACTN2P35609 WASHC2C-201ENST00000336378 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACTN2P35609 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACTN2P35609 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACTN2P35609 ATP13A1-202ENST00000357324 3861 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACTN2P35609 RIC8B-202ENST00000392837 5135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACTN2P35609 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACTN2P35609 NLRP7-209ENST00000592784 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACTN2P35609 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACTN2P35609 PNRC2-201ENST00000334351 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACTN2P35609 CPT1C-202ENST00000323446 2783 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.5 ms