Protein–RNA interactions for Protein: P35499

SCN4A, Sodium channel protein type 4 subunit alpha, humanhuman

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Length 1,836 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN4AP35499 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCN4AP35499 AKR1C2-202ENST00000421196 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCN4AP35499 TPPP3-205ENST00000564104 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCN4AP35499 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCN4AP35499 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCN4AP35499 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCN4AP35499 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCN4AP35499 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCN4AP35499 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCN4AP35499 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCN4AP35499 AC092115.1-201ENST00000566277 1402 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
SCN4AP35499 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCN4AP35499 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCN4AP35499 CHI3L1-201ENST00000255409 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCN4AP35499 AMT-256ENST00000638063 1783 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCN4AP35499 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCN4AP35499 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCN4AP35499 PMF1-203ENST00000368279 1019 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCN4AP35499 IFNLR1-203ENST00000374418 674 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCN4AP35499 PITHD1-202ENST00000374524 1292 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCN4AP35499 SFMBT2-202ENST00000379711 692 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCN4AP35499 GTF2I-203ENST00000443166 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCN4AP35499 DLEU2-205ENST00000443587 705 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCN4AP35499 RN7SL173P-201ENST00000461853 292 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
SCN4AP35499 SMIM15-202ENST00000507416 584 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCN4AP35499 C1orf198-207ENST00000523410 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCN4AP35499 OVOL3-201ENST00000585332 695 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCN4AP35499 AL450487.2-201ENST00000615934 407 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
SCN4AP35499 OVOL3-202ENST00000633214 675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCN4AP35499 AC006207.1-201ENST00000637958 562 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCN4AP35499 ANXA5-202ENST00000501272 1363 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCN4AP35499 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCN4AP35499 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCN4AP35499 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCN4AP35499 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCN4AP35499 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCN4AP35499 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCN4AP35499 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCN4AP35499 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCN4AP35499 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCN4AP35499 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCN4AP35499 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCN4AP35499 IMMT-212ENST00000620815 1520 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCN4AP35499 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
SCN4AP35499 DHRS7C-201ENST00000330255 1006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SCN4AP35499 SEPT7-AS1-201ENST00000412856 587 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SCN4AP35499 SF3B1-204ENST00000414963 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SCN4AP35499 RPL18AP16-201ENST00000424057 531 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
SCN4AP35499 TRAPPC4-202ENST00000434101 794 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SCN4AP35499 SGO1-AS1-201ENST00000441442 499 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SCN4AP35499 AC133141.1-201ENST00000443015 339 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
SCN4AP35499 RN7SL523P-201ENST00000484401 298 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
SCN4AP35499 AC099328.1-201ENST00000498809 1030 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
SCN4AP35499 BAK1P2-201ENST00000532665 631 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
SCN4AP35499 KRT8P34-201ENST00000577607 1044 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
SCN4AP35499 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SCN4AP35499 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SCN4AP35499 COX4I1-208ENST00000564903 1481 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SCN4AP35499 FADS1-206ENST00000460649 1559 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SCN4AP35499 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SCN4AP35499 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SCN4AP35499 C7orf49-214ENST00000620897 1349 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SCN4AP35499 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SCN4AP35499 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SCN4AP35499 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SCN4AP35499 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SCN4AP35499 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SCN4AP35499 IL1F10-201ENST00000341010 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SCN4AP35499 NSMCE1-201ENST00000361439 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SCN4AP35499 AL136084.1-201ENST00000449172 318 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
SCN4AP35499 RPSAP70-201ENST00000504462 864 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
SCN4AP35499 AC137579.2-201ENST00000517714 551 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SCN4AP35499 AC093510.1-202ENST00000546238 442 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SCN4AP35499 MIR6893-201ENST00000613458 69 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
SCN4AP35499 Metazoa_SRP.128-201ENST00000620543 314 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
SCN4AP35499 CCDC86-201ENST00000227520 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SCN4AP35499 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SCN4AP35499 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SCN4AP35499 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
SCN4AP35499 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
SCN4AP35499 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
SCN4AP35499 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
SCN4AP35499 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
SCN4AP35499 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
SCN4AP35499 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC16.83■□□□□ 0.29
SCN4AP35499 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SCN4AP35499 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SCN4AP35499 CFAP36-204ENST00000406691 1575 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SCN4AP35499 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SCN4AP35499 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SCN4AP35499 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SCN4AP35499 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SCN4AP35499 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SCN4AP35499 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SCN4AP35499 RPAIN-202ENST00000381208 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SCN4AP35499 SLC37A4-201ENST00000330775 2102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SCN4AP35499 G0S2-201ENST00000367029 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SCN4AP35499 AC004893.2-203ENST00000482799 796 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SCN4AP35499 AC008494.1-201ENST00000497612 796 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
SCN4AP35499 AC105133.1-201ENST00000559749 742 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
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