Protein–RNA interactions for Protein: P32297

CHRNA3, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA3P32297 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHRNA3P32297 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHRNA3P32297 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CHRNA3P32297 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHRNA3P32297 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHRNA3P32297 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHRNA3P32297 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHRNA3P32297 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CHRNA3P32297 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHRNA3P32297 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHRNA3P32297 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHRNA3P32297 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHRNA3P32297 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNA3P32297 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNA3P32297 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNA3P32297 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNA3P32297 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNA3P32297 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNA3P32297 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNA3P32297 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNA3P32297 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNA3P32297 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNA3P32297 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNA3P32297 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNA3P32297 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNA3P32297 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNA3P32297 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNA3P32297 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNA3P32297 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNA3P32297 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNA3P32297 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNA3P32297 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNA3P32297 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNA3P32297 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNA3P32297 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNA3P32297 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNA3P32297 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNA3P32297 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNA3P32297 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNA3P32297 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNA3P32297 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNA3P32297 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNA3P32297 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNA3P32297 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNA3P32297 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNA3P32297 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNA3P32297 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNA3P32297 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNA3P32297 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNA3P32297 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNA3P32297 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNA3P32297 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNA3P32297 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNA3P32297 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNA3P32297 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNA3P32297 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNA3P32297 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNA3P32297 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNA3P32297 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNA3P32297 CFAP52-202ENST00000396219 1912 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNA3P32297 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNA3P32297 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNA3P32297 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNA3P32297 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNA3P32297 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNA3P32297 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNA3P32297 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNA3P32297 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNA3P32297 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNA3P32297 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNA3P32297 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNA3P32297 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNA3P32297 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNA3P32297 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNA3P32297 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNA3P32297 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNA3P32297 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNA3P32297 AC036214.1-201ENST00000502766 2126 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNA3P32297 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNA3P32297 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNA3P32297 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNA3P32297 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNA3P32297 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNA3P32297 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNA3P32297 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNA3P32297 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNA3P32297 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNA3P32297 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNA3P32297 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNA3P32297 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNA3P32297 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNA3P32297 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNA3P32297 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNA3P32297 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNA3P32297 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNA3P32297 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNA3P32297 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNA3P32297 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNA3P32297 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNA3P32297 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.5 ms