Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPRGP23470 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPRGP23470 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPRGP23470 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPRGP23470 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPRGP23470 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPRGP23470 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPRGP23470 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPRGP23470 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPRGP23470 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPRGP23470 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPRGP23470 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPRGP23470 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPRGP23470 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPRGP23470 SNX15-201ENST00000352068 771 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPRGP23470 TNNT2-207ENST00000367322 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPRGP23470 PLA2G12B-201ENST00000373032 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPRGP23470 EEF1DP5-201ENST00000431410 772 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPRGP23470 AL353658.1-201ENST00000436263 789 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPRGP23470 AC005486.1-201ENST00000466775 216 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPRGP23470 AC008443.1-202ENST00000506340 687 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPRGP23470 CMC2-204ENST00000562713 573 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPRGP23470 CMC2-209ENST00000565108 399 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPRGP23470 AC115099.1-201ENST00000570413 362 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPRGP23470 RN7SL455P-201ENST00000580629 282 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPRGP23470 RNF103-CHMP3-202ENST00000604011 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPRGP23470 AC008906.2-201ENST00000606656 474 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPRGP23470 ESR1-214ENST00000638569 132 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPRGP23470 NECTIN1-203ENST00000341398 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPRGP23470 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPRGP23470 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPRGP23470 GOLGA8K-202ENST00000512626 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPRGP23470 GOLGA8T-202ENST00000569052 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPRGP23470 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPRGP23470 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPRGP23470 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPRGP23470 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPRGP23470 SLC25A31-201ENST00000281154 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPRGP23470 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPRGP23470 AC062028.1-201ENST00000536743 1422 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPRGP23470 C1orf87-202ENST00000450089 1307 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPRGP23470 LINC00115-201ENST00000473798 1317 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPRGP23470 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPRGP23470 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPRGP23470 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPRGP23470 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPRGP23470 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPRGP23470 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPRGP23470 CST9-201ENST00000376971 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPRGP23470 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPRGP23470 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPRGP23470 CLEC20A-202ENST00000623247 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPRGP23470 C11orf53-201ENST00000280325 1208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPRGP23470 SKOR2-201ENST00000400404 891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPRGP23470 HNRNPA1P56-201ENST00000505767 954 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPRGP23470 AC025171.3-201ENST00000509036 472 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPRGP23470 AC093300.1-201ENST00000510368 1201 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPRGP23470 POLR3G-207ENST00000514483 682 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPRGP23470 AC007298.2-201ENST00000551849 862 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPRGP23470 AC073896.4-201ENST00000553176 403 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPRGP23470 IFI27L1-212ENST00000557218 413 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPRGP23470 AC092756.1-201ENST00000560248 448 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPRGP23470 OVOL3-201ENST00000585332 695 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPRGP23470 AC011489.1-201ENST00000586744 690 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPRGP23470 RPL18A-203ENST00000599870 1084 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPRGP23470 AC016586.1-201ENST00000600056 684 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPRGP23470 URAHP-205ENST00000610227 398 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPRGP23470 AC126755.5-201ENST00000622756 267 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPRGP23470 AC026336.4-201ENST00000624565 1050 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPRGP23470 OVOL3-202ENST00000633214 675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPRGP23470 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPRGP23470 WDR46-231ENST00000374617 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPRGP23470 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPRGP23470 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPRGP23470 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPRGP23470 DNAJB13-201ENST00000339764 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPRGP23470 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPRGP23470 DPEP2-202ENST00000393847 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPRGP23470 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPRGP23470 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPRGP23470 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPRGP23470 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPRGP23470 KRT8P43-201ENST00000406052 1458 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPRGP23470 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPRGP23470 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPRGP23470 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPRGP23470 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPRGP23470 AP001628.2-201ENST00000420273 784 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPRGP23470 GSS-202ENST00000451957 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPRGP23470 SLC25A15P3-201ENST00000505530 290 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPRGP23470 HOXC-AS3-203ENST00000514702 368 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPRGP23470 RPAIN-205ENST00000536255 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPRGP23470 TNFRSF12A-204ENST00000573001 648 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPRGP23470 AC023389.1-201ENST00000577846 576 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPRGP23470 AC010127.1-202ENST00000597623 713 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPRGP23470 MCM8-AS1-201ENST00000613522 983 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPRGP23470 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPRGP23470 NNMT-203ENST00000535401 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPRGP23470 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPRGP23470 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
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