Protein–RNA interactions for Protein: O96006

ZBED1, Zinc finger BED domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED1O96006 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
ZBED1O96006 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ZBED1O96006 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ZBED1O96006 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ZBED1O96006 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ZBED1O96006 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ZBED1O96006 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ZBED1O96006 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ZBED1O96006 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ZBED1O96006 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ZBED1O96006 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ZBED1O96006 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ZBED1O96006 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ZBED1O96006 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
ZBED1O96006 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ZBED1O96006 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ZBED1O96006 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ZBED1O96006 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
ZBED1O96006 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
ZBED1O96006 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ZBED1O96006 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ZBED1O96006 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ZBED1O96006 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ZBED1O96006 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ZBED1O96006 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ZBED1O96006 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ZBED1O96006 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ZBED1O96006 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ZBED1O96006 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ZBED1O96006 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ZBED1O96006 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ZBED1O96006 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ZBED1O96006 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.1
ZBED1O96006 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
ZBED1O96006 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZBED1O96006 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
ZBED1O96006 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZBED1O96006 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZBED1O96006 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZBED1O96006 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZBED1O96006 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZBED1O96006 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZBED1O96006 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZBED1O96006 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZBED1O96006 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZBED1O96006 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZBED1O96006 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZBED1O96006 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZBED1O96006 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZBED1O96006 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZBED1O96006 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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ZBED1O96006 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZBED1O96006 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZBED1O96006 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZBED1O96006 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZBED1O96006 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZBED1O96006 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
ZBED1O96006 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZBED1O96006 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZBED1O96006 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
ZBED1O96006 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
ZBED1O96006 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZBED1O96006 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZBED1O96006 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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ZBED1O96006 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZBED1O96006 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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ZBED1O96006 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZBED1O96006 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZBED1O96006 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
ZBED1O96006 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZBED1O96006 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZBED1O96006 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZBED1O96006 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZBED1O96006 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZBED1O96006 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZBED1O96006 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ZBED1O96006 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZBED1O96006 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZBED1O96006 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZBED1O96006 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZBED1O96006 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZBED1O96006 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZBED1O96006 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZBED1O96006 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZBED1O96006 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZBED1O96006 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZBED1O96006 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZBED1O96006 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZBED1O96006 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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