Protein–RNA interactions for Protein: D6RBM5

USP17L23, Putative ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 23, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L23D6RBM5 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
USP17L23D6RBM5 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
USP17L23D6RBM5 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
USP17L23D6RBM5 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
USP17L23D6RBM5 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
USP17L23D6RBM5 NAA60-214ENST00000572584 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
USP17L23D6RBM5 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
USP17L23D6RBM5 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
USP17L23D6RBM5 CACNA1G-228ENST00000514079 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
USP17L23D6RBM5 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
USP17L23D6RBM5 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
USP17L23D6RBM5 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
USP17L23D6RBM5 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
USP17L23D6RBM5 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
USP17L23D6RBM5 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
USP17L23D6RBM5 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
USP17L23D6RBM5 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
USP17L23D6RBM5 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
USP17L23D6RBM5 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
USP17L23D6RBM5 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
USP17L23D6RBM5 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
USP17L23D6RBM5 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
USP17L23D6RBM5 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
USP17L23D6RBM5 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
USP17L23D6RBM5 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
USP17L23D6RBM5 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
USP17L23D6RBM5 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC10.12□□□□□ -0.79
USP17L23D6RBM5 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
USP17L23D6RBM5 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
USP17L23D6RBM5 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
USP17L23D6RBM5 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
USP17L23D6RBM5 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC10.12□□□□□ -0.79
USP17L23D6RBM5 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
USP17L23D6RBM5 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
USP17L23D6RBM5 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
USP17L23D6RBM5 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
USP17L23D6RBM5 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
USP17L23D6RBM5 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
USP17L23D6RBM5 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
USP17L23D6RBM5 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
USP17L23D6RBM5 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
USP17L23D6RBM5 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
USP17L23D6RBM5 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
USP17L23D6RBM5 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
USP17L23D6RBM5 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
USP17L23D6RBM5 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
USP17L23D6RBM5 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
USP17L23D6RBM5 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
USP17L23D6RBM5 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
USP17L23D6RBM5 ERAP1-201ENST00000296754 5495 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
USP17L23D6RBM5 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
USP17L23D6RBM5 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
USP17L23D6RBM5 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
USP17L23D6RBM5 RER1-207ENST00000488353 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
USP17L23D6RBM5 TMPRSS3-203ENST00000398405 2754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
USP17L23D6RBM5 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
USP17L23D6RBM5 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
USP17L23D6RBM5 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
USP17L23D6RBM5 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
USP17L23D6RBM5 OLFML2A-203ENST00000373580 6425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
USP17L23D6RBM5 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
USP17L23D6RBM5 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
USP17L23D6RBM5 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
USP17L23D6RBM5 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
USP17L23D6RBM5 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
USP17L23D6RBM5 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
USP17L23D6RBM5 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
USP17L23D6RBM5 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
USP17L23D6RBM5 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
USP17L23D6RBM5 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
USP17L23D6RBM5 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
USP17L23D6RBM5 RPS6KC1-206ENST00000543354 4082 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
USP17L23D6RBM5 C10orf71-201ENST00000374144 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
USP17L23D6RBM5 MED22-209ENST00000610888 3867 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
USP17L23D6RBM5 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
USP17L23D6RBM5 EGR2-202ENST00000411732 2824 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
USP17L23D6RBM5 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
USP17L23D6RBM5 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
USP17L23D6RBM5 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
USP17L23D6RBM5 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
USP17L23D6RBM5 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
USP17L23D6RBM5 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
USP17L23D6RBM5 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
USP17L23D6RBM5 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
USP17L23D6RBM5 PRDM10-202ENST00000358825 6322 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
USP17L23D6RBM5 PRDM10-203ENST00000360871 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
USP17L23D6RBM5 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
USP17L23D6RBM5 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
USP17L23D6RBM5 KCNH6-202ENST00000456941 2928 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
USP17L23D6RBM5 BMF-201ENST00000354670 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
USP17L23D6RBM5 KCNH4-201ENST00000264661 3920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
USP17L23D6RBM5 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
USP17L23D6RBM5 SLC6A6P1-201ENST00000413933 1850 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
USP17L23D6RBM5 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
USP17L23D6RBM5 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
USP17L23D6RBM5 TIGD6-201ENST00000296736 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
USP17L23D6RBM5 OR52A1-202ENST00000380367 9783 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
USP17L23D6RBM5 LMBRD2-201ENST00000296603 8185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
USP17L23D6RBM5 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
USP17L23D6RBM5 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.6 ms