Protein–RNA interactions for Protein: A6NMD2

GOLGA8J, Golgin subfamily A member 8J, humanhuman

Predictions only

Length 632 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA8JA6NMD2 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GOLGA8JA6NMD2 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GOLGA8JA6NMD2 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GOLGA8JA6NMD2 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GOLGA8JA6NMD2 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GOLGA8JA6NMD2 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GOLGA8JA6NMD2 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GOLGA8JA6NMD2 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GOLGA8JA6NMD2 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GOLGA8JA6NMD2 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GOLGA8JA6NMD2 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GOLGA8JA6NMD2 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GOLGA8JA6NMD2 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GOLGA8JA6NMD2 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GOLGA8JA6NMD2 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GOLGA8JA6NMD2 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GOLGA8JA6NMD2 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GOLGA8JA6NMD2 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GOLGA8JA6NMD2 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GOLGA8JA6NMD2 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GOLGA8JA6NMD2 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GOLGA8JA6NMD2 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GOLGA8JA6NMD2 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GOLGA8JA6NMD2 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GOLGA8JA6NMD2 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GOLGA8JA6NMD2 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GOLGA8JA6NMD2 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GOLGA8JA6NMD2 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GOLGA8JA6NMD2 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GOLGA8JA6NMD2 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GOLGA8JA6NMD2 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GOLGA8JA6NMD2 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GOLGA8JA6NMD2 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GOLGA8JA6NMD2 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GOLGA8JA6NMD2 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GOLGA8JA6NMD2 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GOLGA8JA6NMD2 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GOLGA8JA6NMD2 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GOLGA8JA6NMD2 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GOLGA8JA6NMD2 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GOLGA8JA6NMD2 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
GOLGA8JA6NMD2 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GOLGA8JA6NMD2 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GOLGA8JA6NMD2 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GOLGA8JA6NMD2 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GOLGA8JA6NMD2 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GOLGA8JA6NMD2 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GOLGA8JA6NMD2 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GOLGA8JA6NMD2 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GOLGA8JA6NMD2 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GOLGA8JA6NMD2 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GOLGA8JA6NMD2 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GOLGA8JA6NMD2 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GOLGA8JA6NMD2 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GOLGA8JA6NMD2 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GOLGA8JA6NMD2 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GOLGA8JA6NMD2 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GOLGA8JA6NMD2 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GOLGA8JA6NMD2 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GOLGA8JA6NMD2 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GOLGA8JA6NMD2 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GOLGA8JA6NMD2 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
GOLGA8JA6NMD2 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GOLGA8JA6NMD2 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
GOLGA8JA6NMD2 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GOLGA8JA6NMD2 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GOLGA8JA6NMD2 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GOLGA8JA6NMD2 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GOLGA8JA6NMD2 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
GOLGA8JA6NMD2 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GOLGA8JA6NMD2 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GOLGA8JA6NMD2 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GOLGA8JA6NMD2 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GOLGA8JA6NMD2 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GOLGA8JA6NMD2 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GOLGA8JA6NMD2 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GOLGA8JA6NMD2 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GOLGA8JA6NMD2 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GOLGA8JA6NMD2 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GOLGA8JA6NMD2 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GOLGA8JA6NMD2 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GOLGA8JA6NMD2 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GOLGA8JA6NMD2 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GOLGA8JA6NMD2 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GOLGA8JA6NMD2 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GOLGA8JA6NMD2 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GOLGA8JA6NMD2 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GOLGA8JA6NMD2 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GOLGA8JA6NMD2 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GOLGA8JA6NMD2 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GOLGA8JA6NMD2 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GOLGA8JA6NMD2 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GOLGA8JA6NMD2 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GOLGA8JA6NMD2 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GOLGA8JA6NMD2 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GOLGA8JA6NMD2 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GOLGA8JA6NMD2 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GOLGA8JA6NMD2 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GOLGA8JA6NMD2 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GOLGA8JA6NMD2 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms