Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3E1

HDGFL3, Hepatoma-derived growth factor-related protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL3Q9Y3E1 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
HDGFL3Q9Y3E1 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
HDGFL3Q9Y3E1 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
HDGFL3Q9Y3E1 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
HDGFL3Q9Y3E1 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
HDGFL3Q9Y3E1 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
HDGFL3Q9Y3E1 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
HDGFL3Q9Y3E1 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
HDGFL3Q9Y3E1 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC13.3□□□□□ -0.28
HDGFL3Q9Y3E1 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
HDGFL3Q9Y3E1 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
HDGFL3Q9Y3E1 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
HDGFL3Q9Y3E1 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
HDGFL3Q9Y3E1 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
HDGFL3Q9Y3E1 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
HDGFL3Q9Y3E1 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
HDGFL3Q9Y3E1 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
HDGFL3Q9Y3E1 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
HDGFL3Q9Y3E1 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
HDGFL3Q9Y3E1 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
HDGFL3Q9Y3E1 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
HDGFL3Q9Y3E1 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
HDGFL3Q9Y3E1 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
HDGFL3Q9Y3E1 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
HDGFL3Q9Y3E1 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
HDGFL3Q9Y3E1 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
HDGFL3Q9Y3E1 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
HDGFL3Q9Y3E1 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
HDGFL3Q9Y3E1 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
HDGFL3Q9Y3E1 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
HDGFL3Q9Y3E1 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
HDGFL3Q9Y3E1 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
HDGFL3Q9Y3E1 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
HDGFL3Q9Y3E1 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
HDGFL3Q9Y3E1 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
HDGFL3Q9Y3E1 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
HDGFL3Q9Y3E1 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
HDGFL3Q9Y3E1 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
HDGFL3Q9Y3E1 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
HDGFL3Q9Y3E1 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
HDGFL3Q9Y3E1 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
HDGFL3Q9Y3E1 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
HDGFL3Q9Y3E1 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
HDGFL3Q9Y3E1 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
HDGFL3Q9Y3E1 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
HDGFL3Q9Y3E1 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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HDGFL3Q9Y3E1 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
HDGFL3Q9Y3E1 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
HDGFL3Q9Y3E1 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
HDGFL3Q9Y3E1 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
HDGFL3Q9Y3E1 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
HDGFL3Q9Y3E1 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
HDGFL3Q9Y3E1 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
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HDGFL3Q9Y3E1 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
HDGFL3Q9Y3E1 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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HDGFL3Q9Y3E1 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
HDGFL3Q9Y3E1 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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HDGFL3Q9Y3E1 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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HDGFL3Q9Y3E1 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
HDGFL3Q9Y3E1 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
HDGFL3Q9Y3E1 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
HDGFL3Q9Y3E1 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
HDGFL3Q9Y3E1 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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HDGFL3Q9Y3E1 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
HDGFL3Q9Y3E1 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
HDGFL3Q9Y3E1 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
HDGFL3Q9Y3E1 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
HDGFL3Q9Y3E1 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
HDGFL3Q9Y3E1 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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HDGFL3Q9Y3E1 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
HDGFL3Q9Y3E1 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
HDGFL3Q9Y3E1 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
HDGFL3Q9Y3E1 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
HDGFL3Q9Y3E1 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
HDGFL3Q9Y3E1 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
HDGFL3Q9Y3E1 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
HDGFL3Q9Y3E1 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
HDGFL3Q9Y3E1 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
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