Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBZ4

APEX2, DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase 2, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APEX2Q9UBZ4 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
APEX2Q9UBZ4 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
APEX2Q9UBZ4 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
APEX2Q9UBZ4 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
APEX2Q9UBZ4 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
APEX2Q9UBZ4 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
APEX2Q9UBZ4 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
APEX2Q9UBZ4 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
APEX2Q9UBZ4 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
APEX2Q9UBZ4 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
APEX2Q9UBZ4 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
APEX2Q9UBZ4 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
APEX2Q9UBZ4 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
APEX2Q9UBZ4 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
APEX2Q9UBZ4 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
APEX2Q9UBZ4 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
APEX2Q9UBZ4 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
APEX2Q9UBZ4 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
APEX2Q9UBZ4 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
APEX2Q9UBZ4 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
APEX2Q9UBZ4 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
APEX2Q9UBZ4 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
APEX2Q9UBZ4 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
APEX2Q9UBZ4 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
APEX2Q9UBZ4 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
APEX2Q9UBZ4 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
APEX2Q9UBZ4 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
APEX2Q9UBZ4 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
APEX2Q9UBZ4 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
APEX2Q9UBZ4 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
APEX2Q9UBZ4 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
APEX2Q9UBZ4 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
APEX2Q9UBZ4 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
APEX2Q9UBZ4 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
APEX2Q9UBZ4 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
APEX2Q9UBZ4 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
APEX2Q9UBZ4 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
APEX2Q9UBZ4 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
APEX2Q9UBZ4 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
APEX2Q9UBZ4 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
APEX2Q9UBZ4 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
APEX2Q9UBZ4 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
APEX2Q9UBZ4 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
APEX2Q9UBZ4 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
APEX2Q9UBZ4 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
APEX2Q9UBZ4 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
APEX2Q9UBZ4 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
APEX2Q9UBZ4 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
APEX2Q9UBZ4 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
APEX2Q9UBZ4 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
APEX2Q9UBZ4 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
APEX2Q9UBZ4 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
APEX2Q9UBZ4 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
APEX2Q9UBZ4 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
APEX2Q9UBZ4 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
APEX2Q9UBZ4 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
APEX2Q9UBZ4 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
APEX2Q9UBZ4 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
APEX2Q9UBZ4 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
APEX2Q9UBZ4 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
APEX2Q9UBZ4 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
APEX2Q9UBZ4 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
APEX2Q9UBZ4 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
APEX2Q9UBZ4 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
APEX2Q9UBZ4 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
APEX2Q9UBZ4 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
APEX2Q9UBZ4 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
APEX2Q9UBZ4 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
APEX2Q9UBZ4 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
APEX2Q9UBZ4 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
APEX2Q9UBZ4 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
APEX2Q9UBZ4 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
APEX2Q9UBZ4 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
APEX2Q9UBZ4 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
APEX2Q9UBZ4 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
APEX2Q9UBZ4 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
APEX2Q9UBZ4 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
APEX2Q9UBZ4 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
APEX2Q9UBZ4 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
APEX2Q9UBZ4 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
APEX2Q9UBZ4 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
APEX2Q9UBZ4 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
APEX2Q9UBZ4 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
APEX2Q9UBZ4 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
APEX2Q9UBZ4 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
APEX2Q9UBZ4 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
APEX2Q9UBZ4 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
APEX2Q9UBZ4 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
APEX2Q9UBZ4 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
APEX2Q9UBZ4 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
APEX2Q9UBZ4 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
APEX2Q9UBZ4 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
APEX2Q9UBZ4 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
APEX2Q9UBZ4 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
APEX2Q9UBZ4 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
APEX2Q9UBZ4 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APEX2Q9UBZ4 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APEX2Q9UBZ4 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APEX2Q9UBZ4 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
APEX2Q9UBZ4 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms