Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBD5

ORC3, Origin recognition complex subunit 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 711 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ORC3Q9UBD5 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ORC3Q9UBD5 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ORC3Q9UBD5 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ORC3Q9UBD5 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ORC3Q9UBD5 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ORC3Q9UBD5 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ORC3Q9UBD5 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ORC3Q9UBD5 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ORC3Q9UBD5 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ORC3Q9UBD5 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ORC3Q9UBD5 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ORC3Q9UBD5 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ORC3Q9UBD5 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ORC3Q9UBD5 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ORC3Q9UBD5 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ORC3Q9UBD5 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ORC3Q9UBD5 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ORC3Q9UBD5 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ORC3Q9UBD5 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ORC3Q9UBD5 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ORC3Q9UBD5 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ORC3Q9UBD5 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ORC3Q9UBD5 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ORC3Q9UBD5 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ORC3Q9UBD5 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ORC3Q9UBD5 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ORC3Q9UBD5 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ORC3Q9UBD5 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ORC3Q9UBD5 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ORC3Q9UBD5 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ORC3Q9UBD5 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ORC3Q9UBD5 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ORC3Q9UBD5 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ORC3Q9UBD5 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ORC3Q9UBD5 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ORC3Q9UBD5 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ORC3Q9UBD5 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ORC3Q9UBD5 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ORC3Q9UBD5 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ORC3Q9UBD5 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ORC3Q9UBD5 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ORC3Q9UBD5 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ORC3Q9UBD5 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ORC3Q9UBD5 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ORC3Q9UBD5 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ORC3Q9UBD5 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ORC3Q9UBD5 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ORC3Q9UBD5 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ORC3Q9UBD5 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ORC3Q9UBD5 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ORC3Q9UBD5 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ORC3Q9UBD5 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ORC3Q9UBD5 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ORC3Q9UBD5 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ORC3Q9UBD5 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ORC3Q9UBD5 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ORC3Q9UBD5 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ORC3Q9UBD5 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ORC3Q9UBD5 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ORC3Q9UBD5 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ORC3Q9UBD5 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ORC3Q9UBD5 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ORC3Q9UBD5 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ORC3Q9UBD5 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ORC3Q9UBD5 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ORC3Q9UBD5 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ORC3Q9UBD5 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ORC3Q9UBD5 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ORC3Q9UBD5 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ORC3Q9UBD5 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ORC3Q9UBD5 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ORC3Q9UBD5 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ORC3Q9UBD5 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ORC3Q9UBD5 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ORC3Q9UBD5 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ORC3Q9UBD5 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ORC3Q9UBD5 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ORC3Q9UBD5 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ORC3Q9UBD5 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ORC3Q9UBD5 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ORC3Q9UBD5 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ORC3Q9UBD5 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ORC3Q9UBD5 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ORC3Q9UBD5 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ORC3Q9UBD5 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ORC3Q9UBD5 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ORC3Q9UBD5 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ORC3Q9UBD5 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ORC3Q9UBD5 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ORC3Q9UBD5 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ORC3Q9UBD5 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ORC3Q9UBD5 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ORC3Q9UBD5 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ORC3Q9UBD5 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ORC3Q9UBD5 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ORC3Q9UBD5 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ORC3Q9UBD5 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ORC3Q9UBD5 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ORC3Q9UBD5 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ORC3Q9UBD5 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms