Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E5

CHPF2, Chondroitin sulfate glucuronyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHPF2Q9P2E5 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CHPF2Q9P2E5 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CHPF2Q9P2E5 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CHPF2Q9P2E5 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CHPF2Q9P2E5 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CHPF2Q9P2E5 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CHPF2Q9P2E5 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CHPF2Q9P2E5 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CHPF2Q9P2E5 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CHPF2Q9P2E5 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHPF2Q9P2E5 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHPF2Q9P2E5 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHPF2Q9P2E5 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHPF2Q9P2E5 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHPF2Q9P2E5 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHPF2Q9P2E5 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHPF2Q9P2E5 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHPF2Q9P2E5 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHPF2Q9P2E5 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHPF2Q9P2E5 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHPF2Q9P2E5 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHPF2Q9P2E5 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHPF2Q9P2E5 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHPF2Q9P2E5 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHPF2Q9P2E5 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHPF2Q9P2E5 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHPF2Q9P2E5 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHPF2Q9P2E5 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHPF2Q9P2E5 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CHPF2Q9P2E5 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHPF2Q9P2E5 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHPF2Q9P2E5 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHPF2Q9P2E5 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHPF2Q9P2E5 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CHPF2Q9P2E5 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHPF2Q9P2E5 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHPF2Q9P2E5 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHPF2Q9P2E5 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHPF2Q9P2E5 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHPF2Q9P2E5 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHPF2Q9P2E5 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHPF2Q9P2E5 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHPF2Q9P2E5 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHPF2Q9P2E5 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHPF2Q9P2E5 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHPF2Q9P2E5 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHPF2Q9P2E5 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHPF2Q9P2E5 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHPF2Q9P2E5 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHPF2Q9P2E5 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHPF2Q9P2E5 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHPF2Q9P2E5 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHPF2Q9P2E5 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHPF2Q9P2E5 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHPF2Q9P2E5 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHPF2Q9P2E5 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHPF2Q9P2E5 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHPF2Q9P2E5 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHPF2Q9P2E5 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHPF2Q9P2E5 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHPF2Q9P2E5 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHPF2Q9P2E5 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CHPF2Q9P2E5 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHPF2Q9P2E5 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CHPF2Q9P2E5 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHPF2Q9P2E5 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHPF2Q9P2E5 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHPF2Q9P2E5 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHPF2Q9P2E5 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHPF2Q9P2E5 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHPF2Q9P2E5 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHPF2Q9P2E5 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHPF2Q9P2E5 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHPF2Q9P2E5 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHPF2Q9P2E5 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHPF2Q9P2E5 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CHPF2Q9P2E5 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHPF2Q9P2E5 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHPF2Q9P2E5 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHPF2Q9P2E5 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHPF2Q9P2E5 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHPF2Q9P2E5 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHPF2Q9P2E5 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHPF2Q9P2E5 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHPF2Q9P2E5 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHPF2Q9P2E5 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHPF2Q9P2E5 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHPF2Q9P2E5 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CHPF2Q9P2E5 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CHPF2Q9P2E5 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CHPF2Q9P2E5 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CHPF2Q9P2E5 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CHPF2Q9P2E5 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CHPF2Q9P2E5 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CHPF2Q9P2E5 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CHPF2Q9P2E5 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CHPF2Q9P2E5 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CHPF2Q9P2E5 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CHPF2Q9P2E5 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CHPF2Q9P2E5 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms