Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT67

NDFIP1, NEDD4 family-interacting protein 1, humanhuman

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Length 221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDFIP1Q9BT67 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
NDFIP1Q9BT67 RAP1GAP-211ENST00000495204 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
NDFIP1Q9BT67 PTPRK-204ENST00000368210 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
NDFIP1Q9BT67 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
NDFIP1Q9BT67 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
NDFIP1Q9BT67 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
NDFIP1Q9BT67 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
NDFIP1Q9BT67 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
NDFIP1Q9BT67 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
NDFIP1Q9BT67 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
NDFIP1Q9BT67 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
NDFIP1Q9BT67 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
NDFIP1Q9BT67 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
NDFIP1Q9BT67 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
NDFIP1Q9BT67 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
NDFIP1Q9BT67 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
NDFIP1Q9BT67 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
NDFIP1Q9BT67 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
NDFIP1Q9BT67 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
NDFIP1Q9BT67 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
NDFIP1Q9BT67 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
NDFIP1Q9BT67 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC11.4□□□□□ -0.58
NDFIP1Q9BT67 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC11.4□□□□□ -0.58
NDFIP1Q9BT67 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
NDFIP1Q9BT67 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
NDFIP1Q9BT67 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
NDFIP1Q9BT67 NCBP1-202ENST00000375147 5178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
NDFIP1Q9BT67 CDHR5-203ENST00000397542 3489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
NDFIP1Q9BT67 HADH-202ENST00000403312 1752 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
NDFIP1Q9BT67 XIRP1-201ENST00000340369 6460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
NDFIP1Q9BT67 IRF6-204ENST00000542854 4256 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
NDFIP1Q9BT67 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
NDFIP1Q9BT67 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
NDFIP1Q9BT67 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
NDFIP1Q9BT67 PHTF1-203ENST00000369600 3075 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
NDFIP1Q9BT67 SLC22A12-202ENST00000377567 2599 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
NDFIP1Q9BT67 RRBP1-201ENST00000246043 4737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
NDFIP1Q9BT67 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
NDFIP1Q9BT67 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
NDFIP1Q9BT67 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
NDFIP1Q9BT67 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
NDFIP1Q9BT67 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
NDFIP1Q9BT67 PRKCSH-212ENST00000591462 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
NDFIP1Q9BT67 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
NDFIP1Q9BT67 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
NDFIP1Q9BT67 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
NDFIP1Q9BT67 RTL10-201ENST00000328554 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
NDFIP1Q9BT67 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
NDFIP1Q9BT67 OTUD4-201ENST00000447906 3829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
NDFIP1Q9BT67 ALDH3A2-226ENST00000631291 3822 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
NDFIP1Q9BT67 CSNK1G3-201ENST00000345990 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
NDFIP1Q9BT67 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
NDFIP1Q9BT67 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.59
NDFIP1Q9BT67 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
NDFIP1Q9BT67 LINC01873-201ENST00000428647 1679 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
NDFIP1Q9BT67 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.59
NDFIP1Q9BT67 AC125611.4-201ENST00000553259 4166 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
NDFIP1Q9BT67 ZNF398-201ENST00000426851 5268 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
NDFIP1Q9BT67 DMPK-219ENST00000600757 3357 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
NDFIP1Q9BT67 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
NDFIP1Q9BT67 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
NDFIP1Q9BT67 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
NDFIP1Q9BT67 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
NDFIP1Q9BT67 GSE1-203ENST00000405402 4366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
NDFIP1Q9BT67 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
NDFIP1Q9BT67 MRVI1-204ENST00000527509 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
NDFIP1Q9BT67 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
NDFIP1Q9BT67 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
NDFIP1Q9BT67 RAP1GAP2-201ENST00000254695 6661 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
NDFIP1Q9BT67 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
NDFIP1Q9BT67 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
NDFIP1Q9BT67 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
NDFIP1Q9BT67 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
NDFIP1Q9BT67 SLC6A19-201ENST00000304460 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
NDFIP1Q9BT67 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
NDFIP1Q9BT67 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
NDFIP1Q9BT67 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
NDFIP1Q9BT67 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
NDFIP1Q9BT67 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
NDFIP1Q9BT67 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
NDFIP1Q9BT67 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
NDFIP1Q9BT67 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
NDFIP1Q9BT67 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
NDFIP1Q9BT67 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
NDFIP1Q9BT67 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
NDFIP1Q9BT67 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
NDFIP1Q9BT67 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
NDFIP1Q9BT67 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
NDFIP1Q9BT67 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
NDFIP1Q9BT67 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
NDFIP1Q9BT67 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
NDFIP1Q9BT67 PCCB-210ENST00000471595 6090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
NDFIP1Q9BT67 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
NDFIP1Q9BT67 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC11.39□□□□□ -0.59
NDFIP1Q9BT67 FZD6-206ENST00000523739 2774 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
NDFIP1Q9BT67 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
NDFIP1Q9BT67 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
NDFIP1Q9BT67 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
NDFIP1Q9BT67 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
NDFIP1Q9BT67 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
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