Protein–RNA interactions for Protein: Q96SJ8

TSPAN18, Tetraspanin-18, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN18Q96SJ8 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TSPAN18Q96SJ8 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TSPAN18Q96SJ8 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TSPAN18Q96SJ8 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TSPAN18Q96SJ8 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TSPAN18Q96SJ8 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TSPAN18Q96SJ8 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TSPAN18Q96SJ8 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TSPAN18Q96SJ8 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TSPAN18Q96SJ8 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TSPAN18Q96SJ8 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TSPAN18Q96SJ8 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TSPAN18Q96SJ8 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TSPAN18Q96SJ8 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TSPAN18Q96SJ8 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TSPAN18Q96SJ8 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TSPAN18Q96SJ8 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TSPAN18Q96SJ8 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TSPAN18Q96SJ8 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TSPAN18Q96SJ8 SPDYE16-203ENST00000633306 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TSPAN18Q96SJ8 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TSPAN18Q96SJ8 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TSPAN18Q96SJ8 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TSPAN18Q96SJ8 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TSPAN18Q96SJ8 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TSPAN18Q96SJ8 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TSPAN18Q96SJ8 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TSPAN18Q96SJ8 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TSPAN18Q96SJ8 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TSPAN18Q96SJ8 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TSPAN18Q96SJ8 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TSPAN18Q96SJ8 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TSPAN18Q96SJ8 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TSPAN18Q96SJ8 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TSPAN18Q96SJ8 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TSPAN18Q96SJ8 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TSPAN18Q96SJ8 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TSPAN18Q96SJ8 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TSPAN18Q96SJ8 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TSPAN18Q96SJ8 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TSPAN18Q96SJ8 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TSPAN18Q96SJ8 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TSPAN18Q96SJ8 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TSPAN18Q96SJ8 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TSPAN18Q96SJ8 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TSPAN18Q96SJ8 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TSPAN18Q96SJ8 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TSPAN18Q96SJ8 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TSPAN18Q96SJ8 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TSPAN18Q96SJ8 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TSPAN18Q96SJ8 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TSPAN18Q96SJ8 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TSPAN18Q96SJ8 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TSPAN18Q96SJ8 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TSPAN18Q96SJ8 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TSPAN18Q96SJ8 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TSPAN18Q96SJ8 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TSPAN18Q96SJ8 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TSPAN18Q96SJ8 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TSPAN18Q96SJ8 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TSPAN18Q96SJ8 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TSPAN18Q96SJ8 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TSPAN18Q96SJ8 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TSPAN18Q96SJ8 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TSPAN18Q96SJ8 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TSPAN18Q96SJ8 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TSPAN18Q96SJ8 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TSPAN18Q96SJ8 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TSPAN18Q96SJ8 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TSPAN18Q96SJ8 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TSPAN18Q96SJ8 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TSPAN18Q96SJ8 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TSPAN18Q96SJ8 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TSPAN18Q96SJ8 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TSPAN18Q96SJ8 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TSPAN18Q96SJ8 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TSPAN18Q96SJ8 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TSPAN18Q96SJ8 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TSPAN18Q96SJ8 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TSPAN18Q96SJ8 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TSPAN18Q96SJ8 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TSPAN18Q96SJ8 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TSPAN18Q96SJ8 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TSPAN18Q96SJ8 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TSPAN18Q96SJ8 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TSPAN18Q96SJ8 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TSPAN18Q96SJ8 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TSPAN18Q96SJ8 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TSPAN18Q96SJ8 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TSPAN18Q96SJ8 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TSPAN18Q96SJ8 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TSPAN18Q96SJ8 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TSPAN18Q96SJ8 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TSPAN18Q96SJ8 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TSPAN18Q96SJ8 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TSPAN18Q96SJ8 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TSPAN18Q96SJ8 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TSPAN18Q96SJ8 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TSPAN18Q96SJ8 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TSPAN18Q96SJ8 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms