Protein–RNA interactions for Protein: Q96M63

CCDC114, Coiled-coil domain-containing protein 114, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC114Q96M63 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC114Q96M63 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC114Q96M63 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC114Q96M63 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC114Q96M63 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC114Q96M63 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC114Q96M63 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC114Q96M63 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC114Q96M63 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC114Q96M63 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC114Q96M63 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC114Q96M63 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC114Q96M63 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC114Q96M63 DEPTOR-201ENST00000286234 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC114Q96M63 E2F7-202ENST00000416496 5297 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC114Q96M63 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC114Q96M63 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC114Q96M63 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC114Q96M63 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC114Q96M63 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC114Q96M63 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC114Q96M63 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC114Q96M63 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC114Q96M63 MROH2A-201ENST00000389758 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC114Q96M63 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC114Q96M63 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC114Q96M63 EP400NL-206ENST00000446190 3697 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC114Q96M63 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC114Q96M63 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC114Q96M63 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC114Q96M63 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC114Q96M63 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC114Q96M63 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC114Q96M63 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC114Q96M63 LINC00887-202ENST00000414120 2880 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC114Q96M63 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC114Q96M63 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC114Q96M63 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC114Q96M63 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC114Q96M63 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC114Q96M63 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC114Q96M63 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC114Q96M63 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC114Q96M63 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC114Q96M63 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC114Q96M63 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC114Q96M63 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC114Q96M63 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC114Q96M63 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC114Q96M63 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC114Q96M63 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC114Q96M63 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC114Q96M63 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC114Q96M63 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC114Q96M63 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC114Q96M63 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC114Q96M63 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC114Q96M63 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC114Q96M63 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC114Q96M63 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC114Q96M63 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC114Q96M63 TMEM104-201ENST00000335464 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC114Q96M63 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC114Q96M63 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC114Q96M63 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC114Q96M63 DSN1-203ENST00000373750 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC114Q96M63 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC114Q96M63 XPR1-201ENST00000367589 4126 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC114Q96M63 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC114Q96M63 UBE3A-220ENST00000630424 5075 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC114Q96M63 LATS1-207ENST00000543571 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC114Q96M63 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC114Q96M63 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC114Q96M63 ARAP3-201ENST00000239440 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC114Q96M63 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC114Q96M63 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC114Q96M63 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC114Q96M63 TGIF2-201ENST00000373872 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC114Q96M63 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC114Q96M63 RP1L1-202ENST00000382483 7973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC114Q96M63 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC114Q96M63 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CCDC114Q96M63 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CCDC114Q96M63 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CCDC114Q96M63 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CCDC114Q96M63 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CCDC114Q96M63 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CCDC114Q96M63 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CCDC114Q96M63 SSTR1-201ENST00000267377 4295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CCDC114Q96M63 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CCDC114Q96M63 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CCDC114Q96M63 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CCDC114Q96M63 SMC5-201ENST00000361138 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CCDC114Q96M63 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CCDC114Q96M63 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CCDC114Q96M63 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CCDC114Q96M63 FUK-202ENST00000378912 3925 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CCDC114Q96M63 PCDHB3-201ENST00000231130 3355 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CCDC114Q96M63 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC114Q96M63 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.8 ms