Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB6

SIRT1, NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRT1Q96EB6 AC115099.1-201ENST00000570413 362 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SIRT1Q96EB6 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SIRT1Q96EB6 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SIRT1Q96EB6 SCAF11-203ENST00000395453 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SIRT1Q96EB6 CCL18-201ENST00000616054 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SIRT1Q96EB6 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SIRT1Q96EB6 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SIRT1Q96EB6 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
SIRT1Q96EB6 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SIRT1Q96EB6 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SIRT1Q96EB6 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SIRT1Q96EB6 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SIRT1Q96EB6 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SIRT1Q96EB6 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SIRT1Q96EB6 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SIRT1Q96EB6 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SIRT1Q96EB6 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SIRT1Q96EB6 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SIRT1Q96EB6 AC019109.1-201ENST00000401725 1874 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
SIRT1Q96EB6 SUMF2-210ENST00000437307 947 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SIRT1Q96EB6 CHCHD2P2-201ENST00000503744 321 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
SIRT1Q96EB6 RN7SL455P-201ENST00000580629 282 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
SIRT1Q96EB6 GAS7-216ENST00000583882 553 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SIRT1Q96EB6 AC012073.1-201ENST00000606114 1108 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
SIRT1Q96EB6 ST5-261ENST00000626808 1071 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SIRT1Q96EB6 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SIRT1Q96EB6 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SIRT1Q96EB6 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SIRT1Q96EB6 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SIRT1Q96EB6 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SIRT1Q96EB6 FUCA1P1-201ENST00000374476 1351 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
SIRT1Q96EB6 MSANTD2P1-201ENST00000445341 1368 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
SIRT1Q96EB6 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SIRT1Q96EB6 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SIRT1Q96EB6 SEC13-202ENST00000350697 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SIRT1Q96EB6 PLSCR1-214ENST00000487389 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SIRT1Q96EB6 EMP1-211ENST00000544053 1436 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SIRT1Q96EB6 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SIRT1Q96EB6 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SIRT1Q96EB6 NIT1-204ENST00000392190 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SIRT1Q96EB6 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SIRT1Q96EB6 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SIRT1Q96EB6 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SIRT1Q96EB6 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SIRT1Q96EB6 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SIRT1Q96EB6 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SIRT1Q96EB6 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SIRT1Q96EB6 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SIRT1Q96EB6 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SIRT1Q96EB6 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SIRT1Q96EB6 KRTAP1-3-201ENST00000344363 972 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SIRT1Q96EB6 PMF1-202ENST00000368277 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SIRT1Q96EB6 AC004973.1-201ENST00000413240 635 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SIRT1Q96EB6 RPS27L-203ENST00000439025 970 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SIRT1Q96EB6 DMKN-256ENST00000492341 738 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SIRT1Q96EB6 AC108474.1-201ENST00000507776 421 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SIRT1Q96EB6 CD59-210ENST00000528700 652 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SIRT1Q96EB6 ZNF268-210ENST00000541211 781 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SIRT1Q96EB6 AP005264.5-201ENST00000590066 467 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
SIRT1Q96EB6 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SIRT1Q96EB6 COQ3-201ENST00000254759 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SIRT1Q96EB6 CTBP2P8-201ENST00000422584 1330 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
SIRT1Q96EB6 TSPAN3-205ENST00000558745 1340 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SIRT1Q96EB6 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SIRT1Q96EB6 LINC02537-201ENST00000635943 1367 ntTSL 4 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SIRT1Q96EB6 CEP250-201ENST00000397524 1419 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SIRT1Q96EB6 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SIRT1Q96EB6 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SIRT1Q96EB6 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SIRT1Q96EB6 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SIRT1Q96EB6 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SIRT1Q96EB6 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SIRT1Q96EB6 ALG3-205ENST00000445626 1533 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SIRT1Q96EB6 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SIRT1Q96EB6 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SIRT1Q96EB6 KIR2DS4-201ENST00000339924 1608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SIRT1Q96EB6 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SIRT1Q96EB6 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SIRT1Q96EB6 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SIRT1Q96EB6 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SIRT1Q96EB6 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SIRT1Q96EB6 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SIRT1Q96EB6 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SIRT1Q96EB6 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SIRT1Q96EB6 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SIRT1Q96EB6 MMP7-201ENST00000260227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SIRT1Q96EB6 OR4S1-201ENST00000319988 930 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SIRT1Q96EB6 IGLC1-201ENST00000390321 460 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SIRT1Q96EB6 AC103592.1-201ENST00000394513 664 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
SIRT1Q96EB6 AC093673.1-201ENST00000429630 648 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SIRT1Q96EB6 HIGD1A-203ENST00000430190 741 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SIRT1Q96EB6 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SIRT1Q96EB6 MFAP3-202ENST00000439768 1186 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SIRT1Q96EB6 GRPEL2P1-201ENST00000453145 339 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
SIRT1Q96EB6 KRT18P15-201ENST00000458108 1291 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
SIRT1Q96EB6 RN7SL494P-201ENST00000461517 304 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
SIRT1Q96EB6 PFN2-212ENST00000490975 858 ntTSL 4 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SIRT1Q96EB6 CEP95-212ENST00000581056 903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SIRT1Q96EB6 AC005154.1-232ENST00000582549 556 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SIRT1Q96EB6 AC055811.3-201ENST00000584952 686 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.6 ms