Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBT2

SPC24, Kinetochore protein Spc24, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPC24Q8NBT2 COL4A1-201ENST00000375820 6532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPC24Q8NBT2 MTG2-201ENST00000370823 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPC24Q8NBT2 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPC24Q8NBT2 NIPAL3-203ENST00000358028 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPC24Q8NBT2 KAZN-205ENST00000400798 3643 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPC24Q8NBT2 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SPC24Q8NBT2 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPC24Q8NBT2 EPB41L1-202ENST00000338074 6266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPC24Q8NBT2 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPC24Q8NBT2 UGP2-207ENST00000467648 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPC24Q8NBT2 ADAM19-203ENST00000517905 3312 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPC24Q8NBT2 IFNA6-202ENST00000380210 1544 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPC24Q8NBT2 SUN2-201ENST00000405018 4022 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPC24Q8NBT2 FIBCD1-202ENST00000372338 3253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPC24Q8NBT2 DLGAP4-202ENST00000340491 2392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPC24Q8NBT2 MIER1-202ENST00000355977 3595 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPC24Q8NBT2 PDE2A-203ENST00000418754 2855 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPC24Q8NBT2 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPC24Q8NBT2 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPC24Q8NBT2 USP51-201ENST00000500968 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPC24Q8NBT2 CDH3-201ENST00000264012 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPC24Q8NBT2 DENND1B-211ENST00000620048 8378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPC24Q8NBT2 SLC12A6-206ENST00000558589 3866 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPC24Q8NBT2 JAKMIP3-201ENST00000298622 6626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPC24Q8NBT2 RAB40A-201ENST00000304236 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPC24Q8NBT2 SUCO-201ENST00000263688 5556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPC24Q8NBT2 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPC24Q8NBT2 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPC24Q8NBT2 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPC24Q8NBT2 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPC24Q8NBT2 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPC24Q8NBT2 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPC24Q8NBT2 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SPC24Q8NBT2 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SPC24Q8NBT2 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPC24Q8NBT2 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPC24Q8NBT2 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPC24Q8NBT2 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPC24Q8NBT2 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPC24Q8NBT2 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SPC24Q8NBT2 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPC24Q8NBT2 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPC24Q8NBT2 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPC24Q8NBT2 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPC24Q8NBT2 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPC24Q8NBT2 CFAP157-206ENST00000614677 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPC24Q8NBT2 RHOH-224ENST00000622175 2254 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPC24Q8NBT2 AFDN-211ENST00000447894 5475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPC24Q8NBT2 CTNNB1-202ENST00000396183 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPC24Q8NBT2 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPC24Q8NBT2 GAP43-202ENST00000393780 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPC24Q8NBT2 PLCD4-202ENST00000417849 2738 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPC24Q8NBT2 GSE1-203ENST00000405402 4366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPC24Q8NBT2 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPC24Q8NBT2 NCOA7-203ENST00000392477 6457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPC24Q8NBT2 PHF21B-201ENST00000313237 3671 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPC24Q8NBT2 ADAM17-203ENST00000497134 1873 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPC24Q8NBT2 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPC24Q8NBT2 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPC24Q8NBT2 KIAA1683-201ENST00000392413 4402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPC24Q8NBT2 DDX3X-201ENST00000399959 5399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPC24Q8NBT2 CCNC-210ENST00000520429 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPC24Q8NBT2 KCNJ9-201ENST00000368088 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPC24Q8NBT2 NUDT3-201ENST00000607016 9905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPC24Q8NBT2 STRIP2-202ENST00000435494 2866 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPC24Q8NBT2 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPC24Q8NBT2 EBF3-201ENST00000355311 2993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPC24Q8NBT2 LRSAM1-201ENST00000300417 3146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPC24Q8NBT2 CRYBG2-201ENST00000308182 5245 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPC24Q8NBT2 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPC24Q8NBT2 NOB1-201ENST00000268802 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPC24Q8NBT2 BMT2-201ENST00000297145 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPC24Q8NBT2 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPC24Q8NBT2 SF1-202ENST00000334944 3094 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPC24Q8NBT2 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPC24Q8NBT2 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SPC24Q8NBT2 RAPGEF3-205ENST00000449771 6061 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPC24Q8NBT2 USP19-208ENST00000453664 4719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPC24Q8NBT2 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPC24Q8NBT2 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPC24Q8NBT2 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPC24Q8NBT2 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPC24Q8NBT2 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPC24Q8NBT2 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPC24Q8NBT2 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPC24Q8NBT2 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPC24Q8NBT2 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SPC24Q8NBT2 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPC24Q8NBT2 STK3-218ENST00000617590 2485 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPC24Q8NBT2 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPC24Q8NBT2 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SPC24Q8NBT2 MYLK-201ENST00000346322 5892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPC24Q8NBT2 DPYSL2-204ENST00000521913 4805 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPC24Q8NBT2 S100PBP-203ENST00000373476 3320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPC24Q8NBT2 TNIP3-201ENST00000057513 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPC24Q8NBT2 RPS6KA2-204ENST00000481261 2297 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPC24Q8NBT2 AC113189.2-201ENST00000575310 1975 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPC24Q8NBT2 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPC24Q8NBT2 ACAN-202ENST00000439576 8840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPC24Q8NBT2 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
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