Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWV2

CNTN4, Contactin-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,026 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN4Q8IWV2 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CNTN4Q8IWV2 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CNTN4Q8IWV2 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CNTN4Q8IWV2 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CNTN4Q8IWV2 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CNTN4Q8IWV2 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CNTN4Q8IWV2 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CNTN4Q8IWV2 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CNTN4Q8IWV2 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CNTN4Q8IWV2 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CNTN4Q8IWV2 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CNTN4Q8IWV2 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CNTN4Q8IWV2 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CNTN4Q8IWV2 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CNTN4Q8IWV2 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CNTN4Q8IWV2 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CNTN4Q8IWV2 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CNTN4Q8IWV2 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CNTN4Q8IWV2 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CNTN4Q8IWV2 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CNTN4Q8IWV2 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CNTN4Q8IWV2 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CNTN4Q8IWV2 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CNTN4Q8IWV2 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CNTN4Q8IWV2 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CNTN4Q8IWV2 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CNTN4Q8IWV2 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CNTN4Q8IWV2 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CNTN4Q8IWV2 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CNTN4Q8IWV2 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CNTN4Q8IWV2 HMOX2-216ENST00000613539 1703 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CNTN4Q8IWV2 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CNTN4Q8IWV2 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CNTN4Q8IWV2 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CNTN4Q8IWV2 ETV4-203ENST00000538265 2147 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CNTN4Q8IWV2 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CNTN4Q8IWV2 MARVELD2-203ENST00000436532 1563 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CNTN4Q8IWV2 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CNTN4Q8IWV2 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CNTN4Q8IWV2 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CNTN4Q8IWV2 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CNTN4Q8IWV2 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CNTN4Q8IWV2 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CNTN4Q8IWV2 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CNTN4Q8IWV2 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CNTN4Q8IWV2 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CNTN4Q8IWV2 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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CNTN4Q8IWV2 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CNTN4Q8IWV2 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CNTN4Q8IWV2 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CNTN4Q8IWV2 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CNTN4Q8IWV2 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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CNTN4Q8IWV2 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CNTN4Q8IWV2 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CNTN4Q8IWV2 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CNTN4Q8IWV2 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CNTN4Q8IWV2 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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CNTN4Q8IWV2 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CNTN4Q8IWV2 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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CNTN4Q8IWV2 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CNTN4Q8IWV2 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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CNTN4Q8IWV2 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CNTN4Q8IWV2 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CNTN4Q8IWV2 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CNTN4Q8IWV2 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CNTN4Q8IWV2 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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