Protein–RNA interactions for Protein: Q6STE5

SMARCD3, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 3, humanhuman

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Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCD3Q6STE5 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SMARCD3Q6STE5 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
SMARCD3Q6STE5 GRM1-203ENST00000361719 6754 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SMARCD3Q6STE5 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SMARCD3Q6STE5 SLC35D1-201ENST00000235345 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SMARCD3Q6STE5 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SMARCD3Q6STE5 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SMARCD3Q6STE5 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SMARCD3Q6STE5 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SMARCD3Q6STE5 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SMARCD3Q6STE5 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SMARCD3Q6STE5 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SMARCD3Q6STE5 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SMARCD3Q6STE5 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SMARCD3Q6STE5 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SMARCD3Q6STE5 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SMARCD3Q6STE5 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SMARCD3Q6STE5 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SMARCD3Q6STE5 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SMARCD3Q6STE5 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
SMARCD3Q6STE5 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SMARCD3Q6STE5 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SMARCD3Q6STE5 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SMARCD3Q6STE5 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SMARCD3Q6STE5 PSME4-202ENST00000404125 7099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SMARCD3Q6STE5 KLHL13-207ENST00000540167 3396 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SMARCD3Q6STE5 EDEM3-201ENST00000318130 6898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SMARCD3Q6STE5 TGFBR3-201ENST00000212355 6465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SMARCD3Q6STE5 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SMARCD3Q6STE5 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SMARCD3Q6STE5 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
SMARCD3Q6STE5 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SMARCD3Q6STE5 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SMARCD3Q6STE5 C10orf71-201ENST00000374144 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SMARCD3Q6STE5 PLD2-201ENST00000263088 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SMARCD3Q6STE5 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SMARCD3Q6STE5 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SMARCD3Q6STE5 PRCP-201ENST00000313010 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SMARCD3Q6STE5 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SMARCD3Q6STE5 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SMARCD3Q6STE5 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SMARCD3Q6STE5 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SMARCD3Q6STE5 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SMARCD3Q6STE5 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SMARCD3Q6STE5 PPP2R5E-201ENST00000337537 6659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SMARCD3Q6STE5 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SMARCD3Q6STE5 INO80-202ENST00000401393 5991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SMARCD3Q6STE5 PCDH8-201ENST00000338862 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SMARCD3Q6STE5 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SMARCD3Q6STE5 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SMARCD3Q6STE5 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SMARCD3Q6STE5 PTK7-203ENST00000345201 4071 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SMARCD3Q6STE5 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SMARCD3Q6STE5 SMC5-201ENST00000361138 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SMARCD3Q6STE5 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SMARCD3Q6STE5 GUF1-201ENST00000281543 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SMARCD3Q6STE5 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SMARCD3Q6STE5 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SMARCD3Q6STE5 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SMARCD3Q6STE5 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SMARCD3Q6STE5 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SMARCD3Q6STE5 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SMARCD3Q6STE5 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SMARCD3Q6STE5 SHROOM1-203ENST00000378679 4019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SMARCD3Q6STE5 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SMARCD3Q6STE5 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SMARCD3Q6STE5 PHACTR2-202ENST00000367582 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SMARCD3Q6STE5 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SMARCD3Q6STE5 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SMARCD3Q6STE5 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
SMARCD3Q6STE5 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SMARCD3Q6STE5 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SMARCD3Q6STE5 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SMARCD3Q6STE5 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SMARCD3Q6STE5 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
SMARCD3Q6STE5 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SMARCD3Q6STE5 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SMARCD3Q6STE5 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SMARCD3Q6STE5 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SMARCD3Q6STE5 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SMARCD3Q6STE5 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
SMARCD3Q6STE5 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SMARCD3Q6STE5 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SMARCD3Q6STE5 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
SMARCD3Q6STE5 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SMARCD3Q6STE5 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
SMARCD3Q6STE5 SATB2-211ENST00000614512 4972 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SMARCD3Q6STE5 IRAK3-201ENST00000261233 8663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SMARCD3Q6STE5 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SMARCD3Q6STE5 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SMARCD3Q6STE5 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SMARCD3Q6STE5 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SMARCD3Q6STE5 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SMARCD3Q6STE5 GALNT4-201ENST00000529983 5399 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SMARCD3Q6STE5 TCOF1-207ENST00000504761 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SMARCD3Q6STE5 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SMARCD3Q6STE5 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SMARCD3Q6STE5 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SMARCD3Q6STE5 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SMARCD3Q6STE5 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
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