Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSW7

NANOGP8, Putative homeobox protein NANOGP8, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NANOGP8Q6NSW7 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
NANOGP8Q6NSW7 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
NANOGP8Q6NSW7 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
NANOGP8Q6NSW7 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
NANOGP8Q6NSW7 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
NANOGP8Q6NSW7 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
NANOGP8Q6NSW7 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
NANOGP8Q6NSW7 LDLRAD2-201ENST00000344642 4012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
NANOGP8Q6NSW7 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
NANOGP8Q6NSW7 GABPB1-201ENST00000220429 2726 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
NANOGP8Q6NSW7 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
NANOGP8Q6NSW7 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
NANOGP8Q6NSW7 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
NANOGP8Q6NSW7 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
NANOGP8Q6NSW7 FBXO21-202ENST00000427718 4138 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
NANOGP8Q6NSW7 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
NANOGP8Q6NSW7 ASB3-201ENST00000263634 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
NANOGP8Q6NSW7 ZFP82-201ENST00000392161 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
NANOGP8Q6NSW7 SAFB-211ENST00000592224 3014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
NANOGP8Q6NSW7 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
NANOGP8Q6NSW7 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
NANOGP8Q6NSW7 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
NANOGP8Q6NSW7 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
NANOGP8Q6NSW7 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
NANOGP8Q6NSW7 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
NANOGP8Q6NSW7 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
NANOGP8Q6NSW7 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
NANOGP8Q6NSW7 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
NANOGP8Q6NSW7 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
NANOGP8Q6NSW7 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
NANOGP8Q6NSW7 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
NANOGP8Q6NSW7 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
NANOGP8Q6NSW7 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
NANOGP8Q6NSW7 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
NANOGP8Q6NSW7 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
NANOGP8Q6NSW7 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
NANOGP8Q6NSW7 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
NANOGP8Q6NSW7 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
NANOGP8Q6NSW7 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
NANOGP8Q6NSW7 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
NANOGP8Q6NSW7 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
NANOGP8Q6NSW7 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
NANOGP8Q6NSW7 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
NANOGP8Q6NSW7 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
NANOGP8Q6NSW7 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
NANOGP8Q6NSW7 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
NANOGP8Q6NSW7 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
NANOGP8Q6NSW7 APOB-202ENST00000399256 3128 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
NANOGP8Q6NSW7 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
NANOGP8Q6NSW7 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
NANOGP8Q6NSW7 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
NANOGP8Q6NSW7 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
NANOGP8Q6NSW7 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
NANOGP8Q6NSW7 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
NANOGP8Q6NSW7 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
NANOGP8Q6NSW7 ITGB3-201ENST00000559488 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
NANOGP8Q6NSW7 FOXM1-203ENST00000361953 3370 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
NANOGP8Q6NSW7 MAN2B2-202ENST00000504248 2968 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
NANOGP8Q6NSW7 FAM90A12P-201ENST00000519497 2375 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
NANOGP8Q6NSW7 FAM90A24P-201ENST00000520792 2369 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
NANOGP8Q6NSW7 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
NANOGP8Q6NSW7 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
NANOGP8Q6NSW7 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
NANOGP8Q6NSW7 HADH-202ENST00000403312 1752 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
NANOGP8Q6NSW7 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
NANOGP8Q6NSW7 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
NANOGP8Q6NSW7 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
NANOGP8Q6NSW7 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
NANOGP8Q6NSW7 AC090643.2-201ENST00000623442 2029 ntBASIC14.08□□□□□ -0.15
NANOGP8Q6NSW7 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
NANOGP8Q6NSW7 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.15
NANOGP8Q6NSW7 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.15
NANOGP8Q6NSW7 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.15
NANOGP8Q6NSW7 GID4-201ENST00000268719 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
NANOGP8Q6NSW7 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
NANOGP8Q6NSW7 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
NANOGP8Q6NSW7 CEP70-201ENST00000264982 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
NANOGP8Q6NSW7 TOLLIP-202ENST00000317204 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
NANOGP8Q6NSW7 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
NANOGP8Q6NSW7 CLCNKA-202ENST00000375692 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
NANOGP8Q6NSW7 LGALSL-201ENST00000238875 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
NANOGP8Q6NSW7 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
NANOGP8Q6NSW7 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
NANOGP8Q6NSW7 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
NANOGP8Q6NSW7 SPATS2-223ENST00000553127 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
NANOGP8Q6NSW7 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
NANOGP8Q6NSW7 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
NANOGP8Q6NSW7 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
NANOGP8Q6NSW7 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
NANOGP8Q6NSW7 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
NANOGP8Q6NSW7 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
NANOGP8Q6NSW7 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
NANOGP8Q6NSW7 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
NANOGP8Q6NSW7 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
NANOGP8Q6NSW7 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
NANOGP8Q6NSW7 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
NANOGP8Q6NSW7 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
NANOGP8Q6NSW7 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
NANOGP8Q6NSW7 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
NANOGP8Q6NSW7 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms