Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT33

LINC01545, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01545, humanhuman

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Length 79 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01545Q5VT33 TNK1-201ENST00000570896 3122 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 ADAM32-206ENST00000519315 2168 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 AC124319.4-201ENST00000622931 2161 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 UGT3A1-201ENST00000274278 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 DUSP14-205ENST00000614411 2207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 SH2D7-201ENST00000328828 2750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
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LINC01545Q5VT33 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 MON1B-201ENST00000248248 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 CAMKV-201ENST00000296471 2913 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 LINC01993-201ENST00000374945 2934 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 TNFSF8-201ENST00000223795 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 STAT6-202ENST00000454075 3037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 MTHFSD-204ENST00000546093 2451 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 CX3CL1-204ENST00000565912 5796 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 FGGY-201ENST00000303721 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 BSCL2-206ENST00000405837 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 APOBEC3D-202ENST00000427494 1961 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
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LINC01545Q5VT33 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 FAM224B-201ENST00000458667 2032 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
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LINC01545Q5VT33 CSNK1G1-205ENST00000607537 2083 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 DQX1-202ENST00000404568 2689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 PAQR3-209ENST00000512733 9811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
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LINC01545Q5VT33 PRPF40B-209ENST00000548825 3307 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 NISCH-207ENST00000479054 5173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
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LINC01545Q5VT33 STXBP5L-201ENST00000273666 9496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 GLIS3-202ENST00000381971 3961 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 PGM3-201ENST00000283977 2219 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 EPB42-210ENST00000622454 2227 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
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LINC01545Q5VT33 CXCR5-201ENST00000292174 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
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LINC01545Q5VT33 PAM-203ENST00000346918 3302 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 OSBPL1A-201ENST00000319481 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 ATP6V0A4-202ENST00000353492 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 ESRRB-201ENST00000380887 2745 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
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LINC01545Q5VT33 CDH8-201ENST00000299345 3728 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
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LINC01545Q5VT33 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 ARFIP2-210ENST00000614314 3846 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 JMJD6-208ENST00000617192 5517 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 TBX3-202ENST00000349155 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
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