Protein–RNA interactions for Protein: Q53S48

ALF, STON1-GTF2A1L readthrough, humanhuman

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALFQ53S48 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ALFQ53S48 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ALFQ53S48 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ALFQ53S48 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ALFQ53S48 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ALFQ53S48 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ALFQ53S48 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ALFQ53S48 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ALFQ53S48 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ALFQ53S48 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ALFQ53S48 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ALFQ53S48 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ALFQ53S48 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ALFQ53S48 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ALFQ53S48 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ALFQ53S48 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ALFQ53S48 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ALFQ53S48 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ALFQ53S48 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ALFQ53S48 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ALFQ53S48 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ALFQ53S48 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ALFQ53S48 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ALFQ53S48 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ALFQ53S48 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ALFQ53S48 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ALFQ53S48 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ALFQ53S48 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ALFQ53S48 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ALFQ53S48 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ALFQ53S48 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ALFQ53S48 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ALFQ53S48 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ALFQ53S48 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ALFQ53S48 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ALFQ53S48 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ALFQ53S48 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ALFQ53S48 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ALFQ53S48 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ALFQ53S48 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ALFQ53S48 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ALFQ53S48 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ALFQ53S48 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ALFQ53S48 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ALFQ53S48 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ALFQ53S48 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ALFQ53S48 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ALFQ53S48 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ALFQ53S48 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ALFQ53S48 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ALFQ53S48 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ALFQ53S48 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ALFQ53S48 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ALFQ53S48 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ALFQ53S48 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ALFQ53S48 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ALFQ53S48 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ALFQ53S48 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ALFQ53S48 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ALFQ53S48 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ALFQ53S48 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ALFQ53S48 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ALFQ53S48 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ALFQ53S48 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ALFQ53S48 PRKY-203ENST00000528056 7218 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ALFQ53S48 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ALFQ53S48 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ALFQ53S48 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ALFQ53S48 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ALFQ53S48 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ALFQ53S48 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ALFQ53S48 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ALFQ53S48 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ALFQ53S48 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ALFQ53S48 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ALFQ53S48 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ALFQ53S48 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ALFQ53S48 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ALFQ53S48 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ALFQ53S48 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ALFQ53S48 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ALFQ53S48 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ALFQ53S48 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ALFQ53S48 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ALFQ53S48 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ALFQ53S48 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ALFQ53S48 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ALFQ53S48 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ALFQ53S48 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ALFQ53S48 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ALFQ53S48 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ALFQ53S48 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ALFQ53S48 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ALFQ53S48 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ALFQ53S48 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ALFQ53S48 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ALFQ53S48 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ALFQ53S48 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ALFQ53S48 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ALFQ53S48 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms