Protein–RNA interactions for Protein: Q17RS7

GEN1, Flap endonuclease GEN homolog 1, humanhuman

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Length 908 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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GEN1Q17RS7 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GEN1Q17RS7 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GEN1Q17RS7 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GEN1Q17RS7 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GEN1Q17RS7 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GEN1Q17RS7 DPYSL2-204ENST00000521913 4805 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GEN1Q17RS7 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GEN1Q17RS7 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GEN1Q17RS7 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GEN1Q17RS7 USP3-204ENST00000540797 5474 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GEN1Q17RS7 SPIN3-204ENST00000638257 4835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GEN1Q17RS7 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GEN1Q17RS7 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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GEN1Q17RS7 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GEN1Q17RS7 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GEN1Q17RS7 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
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GEN1Q17RS7 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
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GEN1Q17RS7 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GEN1Q17RS7 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GEN1Q17RS7 AC015712.6-201ENST00000431060 5068 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
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GEN1Q17RS7 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GEN1Q17RS7 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GEN1Q17RS7 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
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GEN1Q17RS7 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GEN1Q17RS7 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GEN1Q17RS7 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GEN1Q17RS7 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GEN1Q17RS7 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GEN1Q17RS7 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GEN1Q17RS7 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GEN1Q17RS7 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
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GEN1Q17RS7 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
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GEN1Q17RS7 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
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GEN1Q17RS7 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GEN1Q17RS7 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GEN1Q17RS7 PTPN23-201ENST00000265562 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GEN1Q17RS7 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
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GEN1Q17RS7 LMBR1-201ENST00000353442 7997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GEN1Q17RS7 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GEN1Q17RS7 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GEN1Q17RS7 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GEN1Q17RS7 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GEN1Q17RS7 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GEN1Q17RS7 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GEN1Q17RS7 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GEN1Q17RS7 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GEN1Q17RS7 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
GEN1Q17RS7 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
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