Protein–RNA interactions for Protein: Q16875

PFKFB3, 6-phosphofructo-2-kinase/fructose-2,6-bisphosphatase 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 520 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFKFB3Q16875 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
PFKFB3Q16875 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PFKFB3Q16875 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PFKFB3Q16875 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
PFKFB3Q16875 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PFKFB3Q16875 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PFKFB3Q16875 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
PFKFB3Q16875 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PFKFB3Q16875 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PFKFB3Q16875 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PFKFB3Q16875 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PFKFB3Q16875 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PFKFB3Q16875 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PFKFB3Q16875 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PFKFB3Q16875 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PFKFB3Q16875 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PFKFB3Q16875 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PFKFB3Q16875 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PFKFB3Q16875 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PFKFB3Q16875 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PFKFB3Q16875 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PFKFB3Q16875 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PFKFB3Q16875 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PFKFB3Q16875 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PFKFB3Q16875 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PFKFB3Q16875 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PFKFB3Q16875 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PFKFB3Q16875 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PFKFB3Q16875 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PFKFB3Q16875 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PFKFB3Q16875 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PFKFB3Q16875 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PFKFB3Q16875 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PFKFB3Q16875 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
PFKFB3Q16875 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
PFKFB3Q16875 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
PFKFB3Q16875 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PFKFB3Q16875 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PFKFB3Q16875 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PFKFB3Q16875 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PFKFB3Q16875 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PFKFB3Q16875 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PFKFB3Q16875 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
PFKFB3Q16875 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
PFKFB3Q16875 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
PFKFB3Q16875 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PFKFB3Q16875 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PFKFB3Q16875 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PFKFB3Q16875 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PFKFB3Q16875 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PFKFB3Q16875 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PFKFB3Q16875 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PFKFB3Q16875 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PFKFB3Q16875 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PFKFB3Q16875 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PFKFB3Q16875 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PFKFB3Q16875 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PFKFB3Q16875 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PFKFB3Q16875 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PFKFB3Q16875 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PFKFB3Q16875 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PFKFB3Q16875 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PFKFB3Q16875 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PFKFB3Q16875 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PFKFB3Q16875 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PFKFB3Q16875 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PFKFB3Q16875 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PFKFB3Q16875 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PFKFB3Q16875 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PFKFB3Q16875 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PFKFB3Q16875 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
PFKFB3Q16875 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PFKFB3Q16875 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
PFKFB3Q16875 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
PFKFB3Q16875 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PFKFB3Q16875 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
PFKFB3Q16875 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PFKFB3Q16875 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
PFKFB3Q16875 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
PFKFB3Q16875 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PFKFB3Q16875 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PFKFB3Q16875 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PFKFB3Q16875 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PFKFB3Q16875 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PFKFB3Q16875 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PFKFB3Q16875 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
PFKFB3Q16875 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PFKFB3Q16875 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
PFKFB3Q16875 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PFKFB3Q16875 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PFKFB3Q16875 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PFKFB3Q16875 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PFKFB3Q16875 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PFKFB3Q16875 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PFKFB3Q16875 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PFKFB3Q16875 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PFKFB3Q16875 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PFKFB3Q16875 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PFKFB3Q16875 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PFKFB3Q16875 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.7 ms