Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

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Length 1,140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 ANG-202ENST00000397990 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
DDB1Q16531 AP002856.2-201ENST00000416553 584 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
DDB1Q16531 OST4-201ENST00000429985 559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
DDB1Q16531 NBPF3-205ENST00000454000 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
DDB1Q16531 AC108474.1-201ENST00000507776 421 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
DDB1Q16531 RPS23-207ENST00000511844 530 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
DDB1Q16531 NUDCD2-202ENST00000517501 448 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
DDB1Q16531 MT2A-202ENST00000561491 581 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
DDB1Q16531 NAV1-210ENST00000593583 726 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
DDB1Q16531 AL021707.6-201ENST00000609212 491 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
DDB1Q16531 CD79B-201ENST00000006750 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
DDB1Q16531 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
DDB1Q16531 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
DDB1Q16531 BABAM2-204ENST00000379624 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
DDB1Q16531 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
DDB1Q16531 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
DDB1Q16531 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
DDB1Q16531 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
DDB1Q16531 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
DDB1Q16531 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
DDB1Q16531 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
DDB1Q16531 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
DDB1Q16531 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
DDB1Q16531 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
DDB1Q16531 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
DDB1Q16531 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
DDB1Q16531 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
DDB1Q16531 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
DDB1Q16531 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
DDB1Q16531 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
DDB1Q16531 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
DDB1Q16531 BIN3-202ENST00000399977 1340 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
DDB1Q16531 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
DDB1Q16531 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
DDB1Q16531 KCTD18-202ENST00000409157 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
DDB1Q16531 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
DDB1Q16531 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
DDB1Q16531 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
DDB1Q16531 VEGFA-201ENST00000230480 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
DDB1Q16531 HTATIP2-202ENST00000421577 886 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
DDB1Q16531 LINC01278-201ENST00000433061 529 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
DDB1Q16531 AL512622.1-202ENST00000443922 478 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
DDB1Q16531 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
DDB1Q16531 CALCA-205ENST00000486207 851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
DDB1Q16531 TRPC7-AS1-201ENST00000514459 460 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
DDB1Q16531 HTATIP2-205ENST00000530266 713 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
DDB1Q16531 VENTXP3-201ENST00000546480 773 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
DDB1Q16531 FOXN3-AS2-201ENST00000554071 1262 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
DDB1Q16531 SNORD3B-1-201ENST00000577988 758 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
DDB1Q16531 ANAPC11-221ENST00000584314 559 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
DDB1Q16531 LINC01278-206ENST00000610088 554 ntTSL 4 BASIC18.83■□□□□ 0.6
DDB1Q16531 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
DDB1Q16531 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
DDB1Q16531 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
DDB1Q16531 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
DDB1Q16531 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
DDB1Q16531 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
DDB1Q16531 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
DDB1Q16531 ZNF576-202ENST00000391965 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
DDB1Q16531 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
DDB1Q16531 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
DDB1Q16531 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
DDB1Q16531 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
DDB1Q16531 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
DDB1Q16531 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
DDB1Q16531 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
DDB1Q16531 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
DDB1Q16531 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
DDB1Q16531 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
DDB1Q16531 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
DDB1Q16531 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
DDB1Q16531 LAMP5-202ENST00000427562 1309 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
DDB1Q16531 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
DDB1Q16531 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
DDB1Q16531 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
DDB1Q16531 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
DDB1Q16531 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
DDB1Q16531 SULT1A1-201ENST00000314752 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
DDB1Q16531 AL929302.1-201ENST00000426556 871 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
DDB1Q16531 PRKAR2A-AS1-203ENST00000431705 592 ntTSL 4 BASIC18.82■□□□□ 0.6
DDB1Q16531 FKBP1B-205ENST00000452109 953 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
DDB1Q16531 LINC00892-203ENST00000454385 686 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
DDB1Q16531 RN7SL375P-201ENST00000492442 298 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
DDB1Q16531 MRPS36-204ENST00000512880 1200 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
DDB1Q16531 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC18.82■□□□□ 0.6
DDB1Q16531 AC145285.5-201ENST00000562217 361 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
DDB1Q16531 MRPS36-205ENST00000602380 1200 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
DDB1Q16531 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
DDB1Q16531 AC067931.2-201ENST00000623655 2003 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
DDB1Q16531 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
DDB1Q16531 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
DDB1Q16531 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
DDB1Q16531 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
DDB1Q16531 ATAT1-206ENST00000376485 1476 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
DDB1Q16531 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
DDB1Q16531 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
DDB1Q16531 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
DDB1Q16531 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
DDB1Q16531 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
DDB1Q16531 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
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