Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

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Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
VPS72Q15906 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
VPS72Q15906 SIAE-206ENST00000618733 1980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
VPS72Q15906 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
VPS72Q15906 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
VPS72Q15906 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
VPS72Q15906 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
VPS72Q15906 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
VPS72Q15906 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
VPS72Q15906 TMEM60-201ENST00000257663 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
VPS72Q15906 CYB5R2-201ENST00000299498 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
VPS72Q15906 IFITM1-201ENST00000328221 844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
VPS72Q15906 MORN2-201ENST00000340556 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
VPS72Q15906 FCN2-202ENST00000350339 943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
VPS72Q15906 FAM163B-201ENST00000356873 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
VPS72Q15906 PPM1N-203ENST00000396737 872 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
VPS72Q15906 DKKL1P1-201ENST00000400550 698 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
VPS72Q15906 KCNK15-AS1-202ENST00000427303 528 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
VPS72Q15906 AL137026.2-201ENST00000437014 841 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
VPS72Q15906 TMEM14B-215ENST00000481240 1032 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
VPS72Q15906 TGFBI-207ENST00000508076 1034 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
VPS72Q15906 AF274856.1-202ENST00000509345 871 ntTSL 4 BASIC18.79■□□□□ 0.6
VPS72Q15906 AC078852.1-201ENST00000515842 441 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
VPS72Q15906 LINC01490-202ENST00000551399 1260 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
VPS72Q15906 AC254633.1-201ENST00000606790 345 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
VPS72Q15906 APOBEC3A-201ENST00000249116 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
VPS72Q15906 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
VPS72Q15906 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
VPS72Q15906 RPL18A-205ENST00000600147 1391 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
VPS72Q15906 C7orf57-201ENST00000348904 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
VPS72Q15906 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
VPS72Q15906 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
VPS72Q15906 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
VPS72Q15906 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
VPS72Q15906 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
VPS72Q15906 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
VPS72Q15906 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
VPS72Q15906 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
VPS72Q15906 SRP9-201ENST00000304786 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
VPS72Q15906 AKR1C2-202ENST00000421196 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
VPS72Q15906 FAM226B-201ENST00000602508 1490 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
VPS72Q15906 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
VPS72Q15906 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
VPS72Q15906 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
VPS72Q15906 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
VPS72Q15906 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
VPS72Q15906 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
VPS72Q15906 ABCD1P4-201ENST00000399687 604 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
VPS72Q15906 RPL3P2-204ENST00000413027 1203 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
VPS72Q15906 MED15P3-201ENST00000413613 326 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
VPS72Q15906 PILRA-205ENST00000453419 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
VPS72Q15906 AC026412.1-206ENST00000502273 206 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
VPS72Q15906 SMUG1-221ENST00000514196 553 ntTSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
VPS72Q15906 AC016582.2-202ENST00000587765 1094 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
VPS72Q15906 AC020922.4-201ENST00000621389 339 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
VPS72Q15906 AL513478.2-202ENST00000621949 835 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
VPS72Q15906 AC010531.8-201ENST00000623341 685 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
VPS72Q15906 C1orf232-202ENST00000635463 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
VPS72Q15906 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
VPS72Q15906 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
VPS72Q15906 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
VPS72Q15906 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
VPS72Q15906 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
VPS72Q15906 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
VPS72Q15906 NCF4-202ENST00000397147 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
VPS72Q15906 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
VPS72Q15906 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
VPS72Q15906 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
VPS72Q15906 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
VPS72Q15906 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
VPS72Q15906 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
VPS72Q15906 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
VPS72Q15906 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
VPS72Q15906 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
VPS72Q15906 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
VPS72Q15906 CNMD-203ENST00000448904 1444 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
VPS72Q15906 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
VPS72Q15906 IL1F10-201ENST00000341010 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
VPS72Q15906 PMF1-203ENST00000368279 1019 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
VPS72Q15906 KIR2DL4-207ENST00000396293 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
VPS72Q15906 MPV17-207ENST00000403262 665 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
VPS72Q15906 CIDEC-205ENST00000443115 443 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
VPS72Q15906 LINC01502-203ENST00000447907 880 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
VPS72Q15906 AC053503.3-201ENST00000448375 114 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
VPS72Q15906 RN7SL578P-201ENST00000477781 283 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
VPS72Q15906 C11orf45-202ENST00000524878 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
VPS72Q15906 RN7SL524P-201ENST00000581152 300 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
VPS72Q15906 AC090004.1-201ENST00000608606 653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
VPS72Q15906 PSME2-217ENST00000615264 874 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
VPS72Q15906 AC048382.6-201ENST00000621980 1223 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
VPS72Q15906 PSME2-218ENST00000630027 185 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
VPS72Q15906 AC245369.7-201ENST00000631386 350 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
VPS72Q15906 AL807740.1-201ENST00000636971 567 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
VPS72Q15906 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
VPS72Q15906 TBC1D3P2-201ENST00000339120 1513 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
VPS72Q15906 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
VPS72Q15906 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
VPS72Q15906 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
VPS72Q15906 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
VPS72Q15906 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
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