Protein–RNA interactions for Protein: Q14938

NFIX, Nuclear factor 1 X-type, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIXQ14938 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NFIXQ14938 CCL18-201ENST00000616054 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NFIXQ14938 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NFIXQ14938 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NFIXQ14938 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NFIXQ14938 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NFIXQ14938 IQCJ-201ENST00000397832 1460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NFIXQ14938 PIGF-202ENST00000306465 1061 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NFIXQ14938 LEMD1-205ENST00000367154 786 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NFIXQ14938 FOXP4-AS1-202ENST00000432751 409 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NFIXQ14938 AL365436.2-201ENST00000434112 526 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NFIXQ14938 ZNF879-202ENST00000519896 543 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NFIXQ14938 AC140658.4-201ENST00000561990 352 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
NFIXQ14938 NDUFB10P1-201ENST00000567319 521 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
NFIXQ14938 AC068025.1-201ENST00000577218 762 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NFIXQ14938 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NFIXQ14938 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NFIXQ14938 AC067931.2-201ENST00000623655 2003 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
NFIXQ14938 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NFIXQ14938 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NFIXQ14938 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NFIXQ14938 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NFIXQ14938 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NFIXQ14938 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NFIXQ14938 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NFIXQ14938 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NFIXQ14938 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NFIXQ14938 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NFIXQ14938 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NFIXQ14938 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NFIXQ14938 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NFIXQ14938 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NFIXQ14938 LINC01029-204ENST00000583106 1465 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NFIXQ14938 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NFIXQ14938 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NFIXQ14938 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NFIXQ14938 RNVU1-8-201ENST00000364272 125 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
NFIXQ14938 AC016757.1-202ENST00000409376 892 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NFIXQ14938 FTCDNL1-203ENST00000420922 772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NFIXQ14938 RLN3-201ENST00000431365 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NFIXQ14938 SIX3-AS1-202ENST00000456467 557 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NFIXQ14938 AC245884.1-201ENST00000457113 529 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NFIXQ14938 RN7SL564P-201ENST00000496309 250 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
NFIXQ14938 AP003068.3-201ENST00000527789 175 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NFIXQ14938 NAA40-205ENST00000539656 577 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NFIXQ14938 GSTZ1-210ENST00000554279 795 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NFIXQ14938 FXYD3-204ENST00000603181 758 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NFIXQ14938 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
NFIXQ14938 PPM1L-201ENST00000295839 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NFIXQ14938 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NFIXQ14938 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NFIXQ14938 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NFIXQ14938 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NFIXQ14938 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NFIXQ14938 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NFIXQ14938 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NFIXQ14938 AL513315.1-201ENST00000640756 1370 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NFIXQ14938 ARMC8-213ENST00000470821 1656 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NFIXQ14938 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NFIXQ14938 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NFIXQ14938 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NFIXQ14938 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NFIXQ14938 TSPAN3-205ENST00000558745 1340 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NFIXQ14938 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NFIXQ14938 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NFIXQ14938 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NFIXQ14938 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NFIXQ14938 IL17B-201ENST00000261796 696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NFIXQ14938 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NFIXQ14938 RAP1B-216ENST00000537460 1072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NFIXQ14938 DUXAP9-201ENST00000547220 665 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NFIXQ14938 AC079174.1-201ENST00000552486 312 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NFIXQ14938 AC009163.3-201ENST00000563554 852 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NFIXQ14938 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
NFIXQ14938 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
NFIXQ14938 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NFIXQ14938 LINC002481-201ENST00000499502 1821 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NFIXQ14938 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NFIXQ14938 CD59-201ENST00000351554 1775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
NFIXQ14938 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NFIXQ14938 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NFIXQ14938 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NFIXQ14938 HTR3E-203ENST00000425359 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NFIXQ14938 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NFIXQ14938 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NFIXQ14938 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NFIXQ14938 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NFIXQ14938 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NFIXQ14938 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NFIXQ14938 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NFIXQ14938 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NFIXQ14938 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NFIXQ14938 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NFIXQ14938 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NFIXQ14938 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NFIXQ14938 BAX-205ENST00000391871 687 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NFIXQ14938 TMEM216-202ENST00000398979 908 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NFIXQ14938 GULP1-204ENST00000409637 1242 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NFIXQ14938 IFI35-203ENST00000415816 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NFIXQ14938 RPL9-203ENST00000449470 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.4 ms