Protein–RNA interactions for Protein: Q08708

CD300C, CMRF35-like molecule 6, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD300CQ08708 IGSF11-202ENST00000393775 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
CD300CQ08708 AL031595.1-201ENST00000623969 4709 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
CD300CQ08708 PAX3-205ENST00000392069 3170 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
CD300CQ08708 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
CD300CQ08708 DAO-201ENST00000228476 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
CD300CQ08708 OR6F1-204ENST00000641470 1762 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
CD300CQ08708 PRKCQ-201ENST00000263125 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
CD300CQ08708 AL162231.4-201ENST00000564224 3264 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
CD300CQ08708 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
CD300CQ08708 PPP2R1A-205ENST00000462990 2730 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
CD300CQ08708 ZNF341-201ENST00000342427 3661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
CD300CQ08708 AL359845.1-201ENST00000458202 1648 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
CD300CQ08708 RBM39-243ENST00000528062 2421 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
CD300CQ08708 CUL4A-203ENST00000375441 4037 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
CD300CQ08708 DZIP1L-201ENST00000327532 3493 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CD300CQ08708 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
CD300CQ08708 AC004834.1-202ENST00000638785 1737 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
CD300CQ08708 R3HDM2-204ENST00000402412 4372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CD300CQ08708 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
CD300CQ08708 SYBU-203ENST00000408889 2776 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
CD300CQ08708 ITFG2-201ENST00000228799 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CD300CQ08708 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
CD300CQ08708 AL139011.2-201ENST00000556710 2635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
CD300CQ08708 DACH2-201ENST00000373125 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CD300CQ08708 BAIAP3-204ENST00000426824 3930 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
CD300CQ08708 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CD300CQ08708 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CD300CQ08708 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CD300CQ08708 CAMKK2-204ENST00000392473 2967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CD300CQ08708 ZNF789-209ENST00000483089 2994 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CD300CQ08708 CAGE1-201ENST00000296742 2821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CD300CQ08708 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
CD300CQ08708 NSUN4-204ENST00000474844 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CD300CQ08708 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CD300CQ08708 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CD300CQ08708 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CD300CQ08708 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
CD300CQ08708 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CD300CQ08708 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
CD300CQ08708 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
CD300CQ08708 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
CD300CQ08708 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC12.65□□□□□ -0.38
CD300CQ08708 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
CD300CQ08708 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CD300CQ08708 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
CD300CQ08708 LGR5-202ENST00000536515 2664 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CD300CQ08708 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CD300CQ08708 AC005906.2-201ENST00000640877 3408 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
CD300CQ08708 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CD300CQ08708 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
CD300CQ08708 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
CD300CQ08708 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CD300CQ08708 CDK5RAP1-202ENST00000346416 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CD300CQ08708 CYP2J2-201ENST00000371204 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CD300CQ08708 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
CD300CQ08708 AC026797.1-201ENST00000624837 2869 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
CD300CQ08708 DNAJC13-201ENST00000260818 7730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CD300CQ08708 PXDN-201ENST00000252804 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CD300CQ08708 ZC3H18-202ENST00000452588 3211 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
CD300CQ08708 SLC13A2-201ENST00000314669 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CD300CQ08708 SLC4A9-201ENST00000432095 3086 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CD300CQ08708 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
CD300CQ08708 ACTN1-205ENST00000538545 2813 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CD300CQ08708 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
CD300CQ08708 CELF3-202ENST00000290585 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
CD300CQ08708 AC004147.4-201ENST00000636421 1844 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.39
CD300CQ08708 CAPN13-201ENST00000295055 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.39
CD300CQ08708 IL17REL-201ENST00000341280 3500 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.39
CD300CQ08708 STIM1-220ENST00000616714 4356 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
CD300CQ08708 FAM122B-203ENST00000370790 4246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CD300CQ08708 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
CD300CQ08708 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CD300CQ08708 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
CD300CQ08708 MIRLET7BHG-201ENST00000360737 4560 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
CD300CQ08708 AL928654.5-201ENST00000624831 2501 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
CD300CQ08708 TRAPPC2L-211ENST00000565504 3102 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
CD300CQ08708 GRIA4-202ENST00000393125 2994 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CD300CQ08708 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CD300CQ08708 UBE2E2-202ENST00000396703 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CD300CQ08708 SATB2-211ENST00000614512 4972 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
CD300CQ08708 PLXNB3-209ENST00000538966 6377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
CD300CQ08708 RCAN2-204ENST00000405162 2457 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
CD300CQ08708 AL357054.4-201ENST00000606285 2814 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
CD300CQ08708 IL2RG-203ENST00000374202 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CD300CQ08708 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
CD300CQ08708 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CD300CQ08708 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
CD300CQ08708 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CD300CQ08708 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CD300CQ08708 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
CD300CQ08708 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CD300CQ08708 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
CD300CQ08708 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
CD300CQ08708 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
CD300CQ08708 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC12.64□□□□□ -0.39
CD300CQ08708 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CD300CQ08708 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
CD300CQ08708 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
CD300CQ08708 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
CD300CQ08708 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.1 ms