Protein–RNA interactions for Protein: Q06643

LTB, Lymphotoxin-beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBQ06643 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LTBQ06643 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LTBQ06643 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LTBQ06643 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LTBQ06643 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LTBQ06643 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LTBQ06643 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LTBQ06643 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LTBQ06643 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LTBQ06643 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LTBQ06643 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LTBQ06643 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LTBQ06643 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
LTBQ06643 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LTBQ06643 LINC01806-201ENST00000436506 765 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LTBQ06643 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
LTBQ06643 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LTBQ06643 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LTBQ06643 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LTBQ06643 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
LTBQ06643 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LTBQ06643 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LTBQ06643 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LTBQ06643 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LTBQ06643 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LTBQ06643 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LTBQ06643 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LTBQ06643 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LTBQ06643 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LTBQ06643 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LTBQ06643 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LTBQ06643 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
LTBQ06643 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LTBQ06643 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LTBQ06643 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LTBQ06643 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LTBQ06643 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LTBQ06643 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LTBQ06643 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LTBQ06643 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LTBQ06643 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LTBQ06643 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LTBQ06643 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LTBQ06643 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LTBQ06643 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LTBQ06643 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LTBQ06643 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LTBQ06643 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LTBQ06643 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LTBQ06643 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LTBQ06643 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LTBQ06643 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LTBQ06643 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LTBQ06643 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LTBQ06643 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LTBQ06643 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LTBQ06643 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
LTBQ06643 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LTBQ06643 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LTBQ06643 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LTBQ06643 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LTBQ06643 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LTBQ06643 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LTBQ06643 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LTBQ06643 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LTBQ06643 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LTBQ06643 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LTBQ06643 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LTBQ06643 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LTBQ06643 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LTBQ06643 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LTBQ06643 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LTBQ06643 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LTBQ06643 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LTBQ06643 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LTBQ06643 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LTBQ06643 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LTBQ06643 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LTBQ06643 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
LTBQ06643 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LTBQ06643 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LTBQ06643 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LTBQ06643 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LTBQ06643 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
LTBQ06643 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LTBQ06643 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LTBQ06643 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LTBQ06643 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LTBQ06643 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LTBQ06643 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LTBQ06643 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LTBQ06643 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LTBQ06643 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LTBQ06643 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LTBQ06643 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LTBQ06643 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LTBQ06643 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LTBQ06643 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LTBQ06643 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LTBQ06643 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms